[发明专利]一种评价公牛精子活力高低的长链非编码RNA组合及其检测方法和应用

摘要

本发明提供一种评价公牛精子活力高低的长链非编码RNA组合及其检测方法和应用，开发出用于评估公牛精子活力的lncRNA标记及分子检测和评价方法，所述方法包括：精液样品的采集与储存；RNA提取，文库构建和转录组测序；转录组组装；候选lncRNA的鉴定及差异表达分析；差异表达lncRNA的染色体定位；筛选用于评价公牛精子活力的功能性lncRNA组合；设计特异引物，建立lncRNA实时荧光定量PCR检测方法。本发明检测方法设计合理、方便，有效检测精液中影响精子活力的新分子标记—功能性lncRNA，这对于基于lncRNA的高繁殖力公牛的分子育种和公牛精液质量的分子评价技术的发展有着重要的意义和实用价值。

主权项

1.一种评价公牛精子活力高低的长链非编码RNA组合，其特征在于，包括下列lncRNA定位染色体的一种或多种：TCONS_00006462，chr11:20027589‑20027796，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；TCONS_00006445，chr11:16735802‑16736013，核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；TCONS_00052267，chr7:23688218‑23688432，核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；TCONS_00005210，chr11:23353411‑23353642，核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；TCONS_00043365，chr4:49814880‑49815099，核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；TCONS_00037129，chr27:22465453‑22465676，核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；TCONS_00006488，chr11:22929103‑22929335，核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示；TCONS_00050707，chr7:28508257‑28508488，核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示；TCONS_00039078，chr29:50150762‑50153142，核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；TCONS_00028106，chr21:54789843‑54790435，核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示；TCONS_00008791，chr12:83016641‑83016844，核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示；TCONS_00055082，chr8:80024030‑80024244，核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示；TCONS_00043041，chr4:6923803‑6924026，核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示；TCONS_00039303，chr29:20825977‑20826212，核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示。