[发明专利]一种河蚬线粒体基因组富集提取及鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201811050921.3 申请日: 2018-09-10
公开(公告)号: CN109112190B 公开(公告)日: 2021-09-17
发明(设计)人: 张彤晴;殷稼雯;唐晟凯;李大命;刘小维;刘燕山;谷先坤 申请(专利权)人: 江苏省淡水水产研究所
主分类号: C12Q1/686 分类号: C12Q1/686;C12Q1/6888;C12Q1/6806
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 竞存;瞿网兰
地址: 210017 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供了河蚬线粒体全基因组DNA的富集、提取以及通过线粒体基因对河蚬进行鉴定的方法。通过本发明提供的富集、提取方法,能够成功地获得河蚬足量的线粒体基因组DNA。本发明根据河蚬线粒体的序列设计nad2‑cox3基因的引物对Mit1,根据cob基因片段设计的引物对Mit2,本发明提供的两对引物对特异性强,能够特异扩增出河蚬的线粒体序列,但对于其他物种的线粒体均扩增不出该基因片段,具有扩增性能好、区分度好、产生副产物少等优点,可以对河蚬进行物种鉴定。
搜索关键词: 一种 线粒体 基因组 富集 提取 鉴定 方法
【主权项】:
1.一种河蚬线粒体基因组富集提取及鉴定方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:S1:待鉴定样品差速离心法粗提线粒体,进而从粗提线粒体中提取待鉴定样品的线粒体基因组DNA;S2:根据河蚬线粒体nad2‑cox3基因设计特异性引物对Mit1,根据河蚬线粒体cob基因设计特异性引物对Mit2;S3:以S1提取的待鉴定样品的线粒体基因组DNA为模板,采用引物对Mit1和/或引物对Mit2进行PCR扩增;S4:将S3获得的PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定和测序鉴定;所述琼脂糖凝胶电泳鉴定为将琼脂糖凝胶电泳条带大小与S3扩增的对应基因的已知分子量对比是否一致,所述nad2‑cox3基因分子量为580bp,所述cob基因分子量为360bp,如果具有与S3扩增的对应基因相同大小的条带则表示待鉴定样品为河蚬;所述测序鉴定为将测序结果与S3扩增的对应基因的已知序列对比是否一致,所述nad2‑cox3基因已知序列如SEQ ID NO.1所示,cob基因已知序列如SEQ ID NO.2所示,如果测序结果与已知序列一致则表示待鉴定样品为河蚬。
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