[发明专利]一种单细胞测序检测活化T细胞的方法在审
申请号: | 201810691767.1 | 申请日: | 2018-06-28 |
公开(公告)号: | CN109251961A | 公开(公告)日: | 2019-01-22 |
发明(设计)人: | 赵永祥;薛志刚;阳诺;钟莉娉;何坚 | 申请(专利权)人: | 广西医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 韦肖燕 |
地址: | 530001 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明公开了一种利用单细胞测序检测活化T细胞的方法,包括以下步骤:(1)获取经异源基因杂交细胞诱导扩增的肿瘤特异性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic lymphocyte,CTL);(2)分离单细胞并进行裂解;(3)对样品的mRNA进行逆转录得到cDNA;(4)以cDNA为模板进行PCR扩增,产物纯化,进行Tagmentation反应,完成cDNA测序文库构建;(5)对构建的cDNA文库进行高通量测序;(6)测序结果进行生物信息学分析,检测T细胞活化程度。 | ||
搜索关键词: | 活化T细胞 测序检测 构建 生物信息学分析 高通量测序 肿瘤特异性 检测T细胞 测序文库 产物纯化 细胞毒性 异源基因 杂交细胞 逆转录 测序 活化 扩增 裂解 诱导 | ||
【主权项】:
1.一种单细胞测序检测活化T细胞的方法,其特征在于:包括以下步骤:1)获取经异源基因杂交细胞诱导扩增的肿瘤特异性CTLs;2)分离单细胞并进行裂解:分离单细胞,加入裂解缓冲液中进行裂解,得到细胞裂解液;3)对样品的mRNA进行逆转录得到cDNA:使用美国ThermoFisher公司的SuperScript试剂盒构建逆转录体系,对上述步骤2)获得的细胞裂解液进行逆转录,得到cDNA;4)以cDNA为模板进行PCR扩增,构建测序文库,进行测序:使用美国Illumina公司的NexteraXT试剂盒,对上述步骤3)得到的逆转录产物进行扩增和纯化,构建高通量测序文库;完成后将文库送交测序;5)对测序结果进行生物信息学分析,检测T细胞的活化程度。
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