[发明专利]一种GII.2型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法有效
| 申请号: | 201810646146.1 | 申请日: | 2018-06-21 |
| 公开(公告)号: | CN108796130B | 公开(公告)日: | 2021-08-17 |
| 发明(设计)人: | 薛亮;吴清平;蔡伟程;蔡淑珍;张乐;张菊梅 | 申请(专利权)人: | 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心);广东环凯微生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
| 地址: | 510070 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种GII.2型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明基于GII.2型诺如病毒基因组所包含的三个开放阅读框,采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.2型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.2型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 gii 型诺如 病毒 基因组 扩增 引物 方法 | ||
【主权项】:
1.一种GII.2型诺如病毒基因组扩增引物,其特征在于,包括六对扩增引物和两条基因组末端的测序引物:引物对1:II‑1F:5'‑GTGAATGAAGATGGCGTCTAAC‑3';II.2‑1R:5'‑GTCAACTCCATTCCGTGGGA‑3';引物对2:II.2‑2F:5'‑AGCCTACATGAAGACCTTGGAC‑3';II.2‑2R:5'‑GCTCTTTCTTCCTTGCGTTG‑3';引物对3:II.2‑3F:5'‑CACGGCATTCTCAAGCAAAG‑3';II.2‑3R:5'‑TCGTCCATCAAACCGCCAAA‑3';引物对4:II.2‑4F:5'‑GAGCACTGGAATGGGGAATC‑3';II‑4R:5'‑CCRCCNGCATRHCCRTTRTACAT‑3';引物对5:II‑5F:5'‑GGAGGGCGATCGCAATC‑3';II‑5R:5'‑CCRGCRAAGAAAGCTCCAGCCAT‑3';引物对6:II.2‑6F:5'‑AAATTCACCCCAGTTGGAC‑3';II.2‑6R:5'‑TCACTAAGCTTGTGACTCC‑3';测序引物:II.2‑seq1R:5'‑GCCCTCTTTCCACATACAGTCC‑3';II.2‑seq6F:5'‑TGAATGCGCCCATGACACAG‑3';R代表A/G,H代表A/C/T,N代表碱基A/C/T/G。
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