[发明专利]一种检测全基因组的单链DNA损伤的方法有效

专利信息
申请号: 201810561048.8 申请日: 2018-06-01
公开(公告)号: CN108753939B 公开(公告)日: 2021-08-03
发明(设计)人: 菲利普·卡帕诺夫;曹慧芬;英格丽·劳伦娜·萨拉·加西亚 申请(专利权)人: 华侨大学
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 代理人: 张松亭;游学明
地址: 362000 福建省*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一种检测全基因组范围的单链DNA损伤的综合性方法。其包括1)使用交联剂进行交联以捕获内源性的单链断裂;2)把染色质碎片化;3)经过核酸酶灭活后,细胞核进一步进行蛋白酶K处理以及交联逆转,分离获得基因组DNA;4)对纯化后的核酸片段进行加尾等步骤。本发明的检测精度至核酸水平。
搜索关键词: 一种 检测 基因组 dna 损伤 方法
【主权项】:
1.一种检测全基因组的单链DNA损伤的方法,它包括如下步骤:1)使用交联剂进行交联以捕获内源性的单链断裂;2)把染色质碎片化,使3’‑OH缺失的片段无法用TdT加尾;3)经过核酸酶灭活后,细胞核进一步进行蛋白酶K处理以及交联逆转,分离获得基因组DNA;4)对纯化后的核酸片段进行加尾,加尾后的基因组DNA直接用于SMS;采用三代测序仪平台测序,获得单链DNA损伤位点。
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