[发明专利]一种用于DNA编码化合物库的试剂筛选的计算机编码方法有效

专利信息
申请号: 201810378969.0 申请日: 2018-04-25
公开(公告)号: CN108959855B 公开(公告)日: 2021-05-18
发明(设计)人: 吴阿亮;刘世恩;张在红;李科;陈雯婷;邢莉;杨洪芳;彭宣嘉 申请(专利权)人: 上海药明康德新药开发有限公司
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G16B15/00
代理公司: 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 代理人: 郑权
地址: 200131 上海市浦东*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及一种用于DNA编码化合物库的试剂筛选的计算机筛选方法,该方法包括以下:试剂的显性查重,试剂按照功能团或骨架分类,试剂隐形(去除保护基或反应基团后)查重,按一定筛选规则对分类的试剂进行筛选,去除不符合要求的试剂。通过本发明的计算机编码方法得到的计算机程序可以高效、简便、快速地把成千上万个试剂进行查重和分类处理,得到可用于DNA编码化合物库构建的具有某一类或几类功能团或骨架的试剂,在DNA编码化合物文库构建中应用前景广泛。
搜索关键词: 一种 用于 dna 编码 化合物 试剂 筛选 计算机 方法
【主权项】:
1.一种用于DNA编码化合物库构建的有机小分子化学试剂筛选的计算机编码方法,其特征在于,收集有机小分子化学试剂的化学结构信息,根据化学结构信息利用试剂查重模块查找重复有机小分子试剂的数据,并去除重复的数据;利用试剂功能团分类模块将有机小分子试剂按照功能团类型和/或功能团数量进行分类;利用试剂骨架分类模块将有机小分子试剂按照小分子骨架分类;筛选出具有符合要求的功能团的有机小分子试剂;筛选方法包括:所述有机小分子试剂去掉保护基、盐和反应功能团后的分子量≤350;所述有机小分子试剂至少具有一个反应功能团,所述反应功能团选自羧基、伯氨基、仲胺基、硼酸、硼酸酯、磺酰氯、异氰酸酯、硫异氰酸酯、酰氯、酸酐、醛、炔烃、叠氮、活性芳卤、苯酚、醇、硫醇中的一种或几种;去除不具有所述反应功能团中任意一种的有机小分子试剂;所述有机小分子试剂不能具有两个或两个以上相同的反应功能团;去除具有两个或两个以上相同的反应功能团的有机小分子试剂;所述有机小分子试剂不能具有两个或两个以上不相同的裸露的在一定条件下可以相互反应的反应功能团,去除具有两个或两个以上不相同的裸露的在一定条件下可以相互反应的功能团的有机小分子试剂;所述有机小分子试剂中含有氨基保护基时,氨基保护基选自Fmoc,Boc,Nvoc,Alloc;所述有机小分子试剂中含有羧酸保护基时,羧酸保护基选自甲酯,乙酯,叔丁酯;所述有机小分子试剂为盐形式时,该有机小分子试剂只能为盐酸盐或氢溴酸盐;所述有机小分子试剂的反应功能团不能为反应活性很低的羧基、醛、氨基、活性芳卤。
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