[发明专利]一种与辣椒果实朝向紧密关联的SNP位点及其通用性分子标记、获取方法和应用有效
| 申请号: | 201810259902.5 | 申请日: | 2018-03-27 |
| 公开(公告)号: | CN110305978B | 公开(公告)日: | 2021-02-12 |
| 发明(设计)人: | 欧阳波;陈蓉;于会洋;李峰;陈文超;欧立军;邹学校 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 杨采良 |
| 地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | 本发明利用基因组重测序数据和全基因组关联分析(GWAS)获得与果实朝向高度关联的单核苷酸多态性(SNP)位点,同时利用果实朝向性状的F2分离群体,通过构建朝向表型的两个极端混池,结合对混池进行RNA测序(BSR),获得与辣椒果实朝向性状紧密连锁的SNP位点,利用两种策略获得的分子标记对朝向性状进行精细定位,开发得到1个紧密连锁的酶切扩增多态性序列(CAPS)标记CaUP12。利用CaUP12对辣椒种质资源进行鉴定,其准确率达到95.6%,利用CaUP12对F2分离群体进行鉴定,准确率达到100%。因此,本发明为辣椒果实朝向控制基因的克隆和辣椒育种提供了紧密关联的分子标记,具有重要的应用价值。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 辣椒 果实 朝向 紧密 关联 snp 及其 通用性 分子 标记 获取 方法 应用 | ||
【主权项】:
1.一种与辣椒果实朝向紧密关联的SNP位点,其特征在于:所述的SNP位点对应于“遵辣1号”参考基因组2.0版本第12号染色体的第37458043位碱基。
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