[发明专利]一种组织淋巴细胞转座酶可接近性染色质分析的建库方法有效
申请号: | 201810139118.0 | 申请日: | 2018-02-11 |
公开(公告)号: | CN108360074B | 公开(公告)日: | 2022-01-18 |
发明(设计)人: | 童云广;徐鹭芹 | 申请(专利权)人: | 奥明(杭州)基因科技有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12N15/10 |
代理公司: | 杭州知见专利代理有限公司 33295 | 代理人: | 赵越剑 |
地址: | 310018 浙江省杭州市江干区杭州经济技术开*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种组织淋巴细胞转座酶可接近性染色质分析的建库方法,本发明首先对动物组织进行前处理,剪碎后过滤,利用细胞分离液进行单个核细胞分离,保证收集的单个核细胞细胞活性较高,加入DnaseI消化死亡细胞的DNA,并利用细胞洗涤液进行洗涤,有效降低背景干扰和成本,再进行Tn5转座酶切反应与纯化,qPCR确定建库所需循环数,最后对得到的单个文库进行等摩尔混合,采用优化过的两轮磁珠比例分选得到高质量的上机文库,为广大科研人员研究动物组织淋巴细胞易接近转座酶核染色质高通量测序提供重要的实验方法参考。 | ||
搜索关键词: | 一种 组织 淋巴细胞 转座酶可 接近 染色质 分析 方法 | ||
【主权项】:
1.一种组织淋巴细胞转座酶可接近性染色质分析的建库方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:动物组织经剪碎过滤处理后,得到单细胞悬浮液A;S2:对单细胞悬浮液A进行单个核细胞分离,得到单个核细胞液B;S3:对单个核细胞液B进行细胞裂解转座反应与纯化,得到转座产物C;S4:对转座产物C进行PCR扩增,得到扩增产物D;S5:取部分扩增产物D进行qPCR以确定额外所需PCR循环数,根据确定的额外所需PCR循环数对剩余扩增产物D继续扩增,得到扩增产物E;S6:纯化扩增产物E得到单一文库,单一文库进行片段分选,得到上机文库。
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