[发明专利]一种基于试剂盒的针对人血液中高分子量基因组DNA的提取方法在审

专利信息
申请号: 201810066733.3 申请日: 2018-01-24
公开(公告)号: CN108359665A 公开(公告)日: 2018-08-03
发明(设计)人: 张哲;傅延;张慧;徐子静 申请(专利权)人: 安徽微分基因科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6806
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 238014 安徽省合肥市巢湖经济开发区龙泉路*** 国省代码: 安徽;34
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摘要: 发明公开了一种基于试剂盒的针对人血液中高分子量基因组DNA的提取方法,包括以下步骤:步骤一:血液样本:预先准备好血液样本、Magen磁珠法组织与D6312血液DNA提取试剂盒,步骤二:细胞裂解:(a)取一个灭菌的1.5ml离心管,加入20ul蛋白酶K,再取200ul血液样本加入到离心管中,立即震荡混匀1秒。本发明通过优化其提取实验步骤和流程从而获取到高纯度、高完整性的高分子量DNA片段,可以满足下游Long‑read测序的需要,DNA无RNA和蛋白污染,DNA片段完整性高,无降解,单个样本提取时间要比常规提取时间短一些,而且也可以进行多个样本的提取,且提取时间并不会增加很多,DNA分子在45kb以上,最大达到130kb左右,结果非常好,完全适合Long‑read测序技术。
搜索关键词: 血液样本 高分子量基因组 离心管 人血液 试剂盒 高分子量DNA 提取试剂盒 测序技术 常规提取 蛋白污染 高完整性 实验步骤 细胞裂解 样本提取 蛋白酶K 血液DNA 磁珠法 高纯度 灭菌 测序 混匀 降解 样本 震荡 优化
【主权项】:
1.一种基于试剂盒的针对人血液中高分子量基因组DNA的提取方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤一:血液样本:预先准备好血液样本、Magen磁珠法组织与D6312血液DNA提取试剂盒;步骤二:细胞裂解:(a)取一个灭菌的1.5ml离心管,加入20ul蛋白酶K,再取200ul血液样本加入到离心管中,立即震荡混匀1秒;(b)立即加入200ul AL,迅速震荡混匀,如果样本量过多,必须单独进行加样以及AL的加入,尽量缩短加液和震荡混匀之间的时间间隔;(c)震荡混匀后,放到掌式离心机上短离1秒,进行温浴,温浴期间每隔3分钟取出轻轻地缓慢地180°颠倒混匀3‑5次,不要进行离心,放回继续温浴即可;(d)温浴后,加入400ul buffer BD和20ul MagBind Particle,轻轻缓慢地180°颠倒混匀20‑30次,室温静置3分钟,期间再轻轻地颠倒混匀数次;(e)静置后,将离心管短离0.5秒,只需要将管盖和管壁上的液体离心下去即可,尽量不要让离心机速度完全升上来;步骤三:磁珠结合:将离心管放到磁力架上,吸附5分钟,然后将废液完全吸净弃掉;步骤四:高盐溶液洗涤三次:加入800ul的BW1buffer,盖上盖子,轻轻的180°颠倒磁力架使BW1buffer完全清洗离心管的内部(包括管盖),180°颠倒清洗1分钟后再静置1分钟,然后放到磁力架上吸附3分钟后吸掉废液,在吸掉废液的时候保持离心管在磁力架上,并尽量洗干净离心管内部的所有废液,包括管底、管盖及管壁上的废液,该步骤中所有的动作需要温柔,且加液的时候不要碰到磁珠,再重复上述步骤两次;步骤五:乙醇洗涤三次:加入800ul的乙醇,盖上盖子,轻轻地180°颠倒磁力架使乙醇完全清洗离心管的内部(包括管盖),颠倒清洗1分钟后,然后放到磁力架上吸附3分钟后吸掉废液,在吸掉废液的时候保持离心管在磁力架上,并尽量吸干净离心管内部的所有废液,包括管底、管盖及管壁上的废液,再重复上述步骤两次;步骤六:DNA回溶:(a)将离心管从磁力架上取下,盖上盖子,短离3次,每次0.5秒,每次离心的速度尽量不要过大,以避免对DNA片段造成影响,只需要把管盖及管壁上的大部分液体离心至管底即可,如果管壁有残留的小块儿液体并无影响;(b)将离心管放到磁力架上开盖吸附2分钟,吸掉管底的残留液体,然后开盖晾干5‑10分钟,晾干过程中如果管壁有残留的小块儿液体,用枪头将液体打散以加速液体的蒸发;另外晾干时间按实际情况而定,当管壁上的液体蒸发干净以及磁珠失去光泽后即可闭盖停止晾干;(c)将离心管从磁力架上取下,每管加入32ul的EB,用移液器轻轻地将吹打磁珠,使之从管壁上剥落至液体里,然后盖上管盖,轻弹混匀,进行温浴,温浴期间,每隔1‑2分钟取出轻弹混匀;(d)将离心管放到磁力架上吸附5分钟,然后将DNA溶液转移至新的1.5ml离心管内。
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