[发明专利]用于抗微生物剂敏感性预测的流式细胞术数据处理

摘要

一种在易感、中间和抗性表型中预测测试微生物对抗微生物剂的敏感性表型的方法，所述方法包括学习阶段和预测阶段。学习阶段包括选择具有根据EUCAST或CLSI方法所测定不同已知敏感性表型的广泛不同菌株，对于液体样品中分配的各个所述菌株获得FCM分布，所述样品具有荧光标记物和不同抗生素浓度，以及在涉及衍生自FCM采集的特征向量的单或多维空间上进行学习机计算，以获得对所述抗生素敏感性表型的预测模型。

主权项

1.一种在易感、中间和抗性表型中预测测试微生物对抗微生物剂敏感性表型的方法，所述方法包括：A.包含以下步骤的学习阶段：a.选择包含易感、中间和抗性表型微生物的一组微生物，所述表型基于所述抗微生物剂的易感和抗性断点浓度确定，并产生所述微生物组的一数字组的敏感性表型；b.对于所述微生物组的各微生物，制备液体样品，该样品包括所述微生物群、靶向所述微生物的活力荧光标记和所述抗微生物剂，所述液体样品包括至少2种不同浓度的所述抗微生物剂；c.对于各微生物，通过流式细胞仪获得一数字组的值，包括所述样品中微生物群的荧光分布和/或前向散射分布和/或侧向散射分布；d.对于所述微生物组的各微生物，通过计算机单元基于就所述微生物获得的各组值产生特征向量；e.通过计算机单元基于产生的特征向量和所述数字组的敏感性表型学习对所述抗微生物剂的敏感性表型的预测模型；B.包含以下步骤的预测阶段：f.制备液体样品，该样品包括测试微生物群、所述活力荧光标记和不同浓度的所述抗微生物剂；g.对于测试微生物的各样品，通过流式细胞仪获得一数字组的值，对应于步骤c)所获得的那组值；h.通过计算机单元基于就测试微生物获得的各组值产生特征向量，所述特征向量对应于步骤d)的特征向量；i.通过保存预测模型的计算机单元，将所述模型应用于测试微生物的特征向量预测测试微生物的敏感性表型。