[发明专利]一种猪全基因组sgRNA文库及其构建方法和应用在审
| 申请号： | 201711490244.2 | 申请日： | 2017-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN108221058A | 公开（公告）日： | 2018-06-29 |
| 发明（设计）人： | 许朋阳;徐凤丹;段广有;闵文波;夏步高;葛毅 | 申请（专利权）人： | 苏州金唯智生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C40B40/06 | 分类号： | C40B40/06;C40B50/06;C12N15/113 |
| 代理公司： | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人： | 巩克栋 |
| 地址： | 215123 江苏省苏*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种猪全基因组sgRNA文库及其构建方法和应用，所述文库包括猪(Sus scrofus)全基因组中20438个基因的sgRNA序列，其中17410个基因设计得到6条sgRNA，2828个基因设计得到sgRNA数量在1‑5条之间，所述sgRNA的获取过程为：首先在靶序列上获取候选sgRNA，然后对候选sgRNA进行脱靶分析并打分，最后根据打分结果对sgRNA过滤；本发明通过采用多种设计标准及筛选原则，优化模块内细节及流程，最终构建得到猪全基因组sgRNA文库，所述方法简洁高效，得到的文库质量高，活性好，便于应用在基因编辑研究中。 | ||
| 搜索关键词： | 文库 全基因组 构建 基因设计 种猪 应用 设计标准 优化模块 靶序列 基因 过滤 筛选 分析 研究 | ||
【主权项】：
1.一种猪全基因组sgRNA文库，其特征在于，所述文库包括猪(Sus scrofus)全基因组中的20438个基因的sgRNA；所述sgRNA的获取过程为：首先在靶序列上获取候选sgRNA，然后对候选sgRNA进行脱靶分析并打分，最后根据打分结果对sgRNA过滤。
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