[发明专利]一种循环肿瘤DNA低频突变的检测方法有效
| 申请号： | 201711421739.X | 申请日： | 2017-12-25 |
| 公开（公告）号： | CN108866174B | 公开（公告）日： | 2023-05-19 |
| 发明（设计）人： | 刘青青;谢文龙;曾缘欢;陈荣山;李宇;温恒斌;肖辛野;姚迅;李奇渊;李晓哲 | 申请（专利权）人： | 厦门基源医疗科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 361000 福建省厦门市*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种循环肿瘤DNA（以下简称ctDNA）低频突变的检测方法。该方法包括以下步骤：S1，从血浆中提取cfDNA；S2，对所提取的cfDNA进行末端修复和3’端加“A”；S3，对末端修复产物进行接头连接，该接头含有随机分子标签序列，同时含有用于区分不同样本的index序列；S4，对接头连接产物进行PCR扩增；S5，探针捕获目的文库；S6，通过illumina Miseq、illumina Nextseq、illumina Hiseq平台进行测序，并对下机数据进行分析。该方法适用于探针靶向捕获测序，能够降低下机数据重复率，去除PCR及测序过程中产生的错误，提高ctDNA检测灵敏度和特异性，降低假阳性率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 循环 肿瘤 dna 低频 突变 检测 方法 | ||
【主权项】：
1.一种ctDNA低频突变的检测方法，其特征在于，所使用的接头由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的两条序列退火而成；所述SEQ ID NO.1含有随机分子标签序列，该随机分子标签序列长14bp，序列为NNANNTNNCNNGNN，位于Index2位置上，其中，N表示ATCG四种碱基中任意一种，每两个随机碱基分别由一个A或T或C或G碱基隔开；所述SEQ ID NO.2序列含有用于区分不同样本的index序列，该index序列长6bp，由ATCG四种碱基组成。
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