[发明专利]一种从头测序方法有效

专利信息
申请号: 201710913734.2 申请日: 2017-09-30
公开(公告)号: CN107729719B 公开(公告)日: 2020-05-26
发明(设计)人: 杨皓;迟浩;曾文锋;周文婧;刘超;贺思敏 申请(专利权)人: 中国科学院计算技术研究所
主分类号: G16B25/00 分类号: G16B25/00;G16B45/00;G16B50/30
代理公司: 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 代理人: 王勇;李科
地址: 100190 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提一种从头测序方法,该方法包括:在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图;从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰;根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图,其中,所述高可信谱峰对应的结点是高可信结点,普通谱峰对应的结点是普通结点;基于所构建的有向无环图生成候选肽段。本发明的方法利用镜像谱图相互佐证,能够提高肽段从头测序的准确率。
搜索关键词: 一种 从头 方法
【主权项】:
一种从头测序方法,包括以下步骤:步骤1:在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图;步骤2:从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰;步骤3:根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图,其中,所述高可信谱峰对应的结点是高可信结点,普通谱峰对应的结点是普通结点;步骤4:基于所构建的有向无环图生成候选肽段。
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