[发明专利]一种从头测序方法有效
| 申请号: | 201710913734.2 | 申请日: | 2017-09-30 |
| 公开(公告)号: | CN107729719B | 公开(公告)日: | 2020-05-26 |
| 发明(设计)人: | 杨皓;迟浩;曾文锋;周文婧;刘超;贺思敏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院计算技术研究所 |
| 主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B45/00;G16B50/30 |
| 代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 王勇;李科 |
| 地址: | 100190 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | 本发明提一种从头测序方法,该方法包括:在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图;从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰;根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图,其中,所述高可信谱峰对应的结点是高可信结点,普通谱峰对应的结点是普通结点;基于所构建的有向无环图生成候选肽段。本发明的方法利用镜像谱图相互佐证,能够提高肽段从头测序的准确率。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 从头 方法 | ||
【主权项】:
一种从头测序方法,包括以下步骤:步骤1:在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图;步骤2:从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰;步骤3:根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图,其中,所述高可信谱峰对应的结点是高可信结点,普通谱峰对应的结点是普通结点;步骤4:基于所构建的有向无环图生成候选肽段。
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