[发明专利]一种从头测序方法

权利要求书

1.一种从头测序方法，包括以下步骤：

步骤1：在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图，其中，所述两个数据集是使用胰蛋白酶在氨基酸K、R的C端酶切产生的数据集以及使用镜像胰蛋白酶在氨基酸的K、R的N端酶切产生的数据集；

步骤2：从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰；

步骤3：根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图，其中，所述高可信谱峰对应的结点是高可信结点，普通谱峰对应的结点是普通结点；

步骤4：基于所构建的有向无环图生成候选肽段。

2.根据权利要求1所述的从头测序方法，其中，形式为A₁A₂…A_l[K/R/-]和[K/R/-]A₁A₂…A_l的两条肽段是镜像肽段，前者是胰蛋白酶产生的肽段，后者是镜像胰蛋白酶产生的肽段，A_i至A_l是20种氨基酸的任意一种，“-”表示无氨基酸，K表示氨基酸K，R表示氨基酸R。

3.根据权利要求1所述的从头测序方法，其中，步骤1包括：

对于某张胰蛋白酶谱图T，在镜像胰蛋白酶数据集中查找符合镜像肽段母离子质量差的谱图L；

将与谱图L匹配度最高的肽段转化为胰蛋白酶谱图对应的肽段，并将转后的肽段与谱图T进行匹配打分；

将谱图T匹配度最高的肽段转化为镜像胰蛋白酶谱图对应的肽段，并将转换后的肽段与谱图L进行匹配打分；

综合两个打分获得打分结果，如果打分结果超过阈值，则谱图T和L是镜像谱图。

4.根据权利要求1所述的从头测序方法，其中，所述高可信谱峰是满足下列公式中任一项的谱峰：

m_q＝m_p+128

m_q＝m_p+156

m_q＝m_p-128

m_q＝m_p-156

m_q＝(Q+1)-(m_p+128)

m_q＝(Q+1)-(m_p+156)

m_q＝(Q+1)-(m_p-128)

m_q＝(Q+1)-(m_p-156)

其中，m_p和i_p分别表示胰蛋白酶谱图中第p根谱峰的质量和强度，m_q和i_q分别表示镜像胰蛋白酶谱图中第q根谱峰的质量和强度，Q表示镜像胰蛋白酶谱图的母离子质量。