[发明专利]一种快速检测融合基因的方法在审
| 申请号： | 201710293318.7 | 申请日： | 2017-04-28 |
| 公开（公告）号： | CN107437002A | 公开（公告）日： | 2017-12-05 |
| 发明（设计）人： | 闫成海;唐元华;徐健 | 申请（专利权）人： | 首度生物科技（苏州）有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22 |
| 代理公司： | 北京恒泰铭睿知识产权代理有限公司11642 | 代理人： | 胡艳 |
| 地址： | 215123 江苏省苏州市苏州*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供一种快速检测融合基因的方法，包括以下步骤A.建立融合基因数据库将已知的融合基因断裂点以及断裂点前面的N个序列和断裂点后面的M个序列组成种子，种子的集合形成融合基因数据库；B.获取待检测基因;D.将种子与待检测基因的序列数据比对，确定待检测基因的序列数据是否包含种子信息；E.当包含待检测基因包含种子信息时，则认为待检测基因内含有融合基因；否则认为不包含融合基因。本发明弃用了常规的融合基因寻找方法，通过建立新的融合基因数据库，采用执果索因的方式，不需要与人类基因组进行比较，避免了既耗时又可能产生错误的比对基因组步骤，使得此种方法检测速度可提高几十倍，很少的内存需求下完成分析,并且防止了比较错误引起的误判。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 快速 检测 融合 基因 方法 | ||
【主权项】：
一种快速检测融合基因的方法，其特征在于，包括以下步骤：A.建立融合基因数据库：将已知的融合基因断裂点以及断裂点前面的N个序列和断裂点后面的M个序列组成种子，种子的集合形成融合基因数据库；B.获取待检测基因：通过基因检测装置，获取待检测基因的序列数据;D.将种子与待检测基因的序列数据比对，确定待检测基因的序列数据是否包含种子信息;E.当包含待检测基因包含种子信息时，则认为待检测基因内含有融合基因；否则认为不包含融合基因。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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