[发明专利]一种快速检测融合基因的方法在审

专利信息
申请号: 201710293318.7 申请日: 2017-04-28
公开(公告)号: CN107437002A 公开(公告)日: 2017-12-05
发明(设计)人: 闫成海;唐元华;徐健 申请(专利权)人: 首度生物科技(苏州)有限公司;苏州首度基因科技有限责任公司
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22
代理公司: 北京恒泰铭睿知识产权代理有限公司11642 代理人: 胡艳
地址: 215123 江苏省苏州市苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 检测 融合 基因 方法
【权利要求书】:

1.一种快速检测融合基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:

A.建立融合基因数据库:将已知的融合基因断裂点以及断裂点前面的N个序列和断裂点后面的M个序列组成种子,种子的集合形成融合基因数据库;

B.获取待检测基因:通过基因检测装置,获取待检测基因的序列数据;

D.将种子与待检测基因的序列数据比对,确定待检测基因的序列数据是否包含种子信息;

E.当包含待检测基因包含种子信息时,则认为待检测基因内含有融合基因;否则认为不包含融合基因。

2.根据权利要求1所述的快速检测融合基因的方法,其特征在于,在所述步骤B之后还包括步骤C.将序列数据建立数据库索引。

3.根据权利要求1所述的快速检测融合基因的方法,其特征在于,在所述步骤D之后还包括步骤F.当含有融合基因时,判断待检测基因包含融合基因的含量,当融合基因的含量大于一定阈值时,提示存在风险。

4.根据权利要求1所述的快速检测融合基因的方法,其特征在于,所述步骤B中的基因检测装置为二代高通量测序平台或三代测序平台或基因芯片。

5.根据权利要求1所述的快速检测融合基因的方法,其特征在于,所述步骤A中,N≥5或M≥5。

6.根据权利要求1所述的快速检测融合基因的方法,其特征在于,所述步骤D中种子与序列数据采用局部比对。

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