[发明专利]一种检测MET基因14外显子突变的探针库、检测方法和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201710177071.2 申请日: 2017-03-23
公开(公告)号: CN106834515B 公开(公告)日: 2018-05-04
发明(设计)人: 邵阳;吴雪;那成龙;赵忞超;王延宾 申请(专利权)人: 南京世和基因生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 南京正联知识产权代理有限公司32243 代理人: 邓唯
地址: 210061 江苏省南京市高新开发区*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供一种检测MET基因14外显子突变的探针及检测方法,所述DNA探针库包括一个或多个能够与MET基因14外显子及相邻内含子进行杂交的DNA探针。所述DNA探针可以如SEQ ID NO.1~46所示。此外,本发明提供利用该探针库对MET基因14外显子及相邻内含子进行富集及检测的方法,采用此方法与下一代测序技术(NGS)相结合可以极大地提高MET14基因检测的敏感性,准确性与全面性。
搜索关键词: 一种 检测 met 基因 14 外显子 突变 探针 方法 试剂盒
【主权项】:
试剂盒在用于非治疗与诊断目的的MET基因14外显子突变测序中的应用,所述试剂盒包括核苷酸序列如SEQ ID NO. 1~46所示的全部探针;所述的应用中,包括如下步骤:1)获得受试者的DNA样本库;2)获得所述的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1~46所示的全部探针;3)使所述的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1~46所示的全部探针与所述DNA样本库进行杂交;和4)分离步骤3)的杂交产物,然后释放经杂交富集的MET基因14外显子基因片段;采用下一代测序技术,通过对富集到的MET基因14外显子片段进行测序而检测所述MET基因14外显子片段的突变;所述步骤1)中的DNA样本库由双链DNA片段组成;所述步骤1)包括:提取全基因组DNA,然后将其片段化;或者提取mRNA,将其片段化,然后以该经片段化的mRNA为模板合成双链cDNA;所述受试者为哺乳动物;哺乳动物是人;从受试者的细胞、组织或体液样本中提取全基因组DNA或mRNA;所述DNA片段的长度为150~200bp;所述步骤3)包括:3‑1)采用选择性标记标记DNA探针库中的DNA探针;和3‑2)使所述DNA探针库与DNA样本库进行杂交;所述步骤3‑1)中的选择性标记为生物素;所述步骤3‑2)包括在PCR扩增仪中,在65℃下将所述DNA探针库与DNA样本库孵育24小时;所述方法的步骤4)中,利用DNA探针上的选择性标记分离杂交产物;所述步骤4)中利用链霉亲和素‑生物素的亲和作用分离杂交产物。
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