[发明专利]一种膀胱癌的无创检测及其复发监测方法在审

专利信息
申请号: 201710153638.2 申请日: 2017-03-15
公开(公告)号: CN106755547A 公开(公告)日: 2017-05-31
发明(设计)人: 耿荷芳;任军;粱覃思;薄世平;陆思嘉 申请(专利权)人: 上海亿康医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12M1/34;G06F19/18;G06F19/00
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司31266 代理人: 王正君,陆凤
地址: 201499 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明提供了一种膀胱癌的无创检测及其复发监测方法,具体地,本发明提供了一种非治疗性非诊断性的诊断膀胱癌的方法,本发明的方法可提高膀胱癌检测的灵敏性和通用性。
搜索关键词: 一种 膀胱癌 检测 及其 复发 监测 方法
【主权项】:
一种非治疗性非诊断性的检测样本中突变位点的方法,其特征在于,包括步骤:(i)提供一待测样本;(ii)对所述待测样本进行测序,从而获得所述样本的基因组序列;(iii)将步骤(ii)获得的基因组序列与参考基因组进行比对,从而获得基因组序列在参考基因组上的位置信息;(iv)将所述的参考基因组分成M个区域片段,其中每个区域片段为一个窗口b,计算每个窗口b的拷贝数;(v)对步骤(iv)的每个窗口b进行Z检验,从而计算每个窗口b的Z值;(vi)根据步骤(v)所得到的Z值,计算全基因组混乱度评分(WGAS,Whole genomic abnormality score);和(vii)基于全基因组混乱度评分(WGAS),对于评分大于预定值Vd的样本进一步检测所述样本中的肿瘤相关的突变位点,从而获得所述待测样本中的肿瘤相关突变位点的检测结果。
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