[发明专利]用于长片段阅读测序的方法和组合物在审
| 申请号： | 201710128962.9 | 申请日： | 2010-06-15 |
| 公开（公告）号： | CN107267596A | 公开（公告）日： | 2017-10-20 |
| 发明（设计）人： | R·德马纳克;B·A·彼得斯;A·亚历克斯埃夫;P·洪 | 申请（专利权）人： | 考利达基因组股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 上海胜康律师事务所31263 | 代理人： | 李献忠,邱晓敏 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明涉及用于长片段阅读测序的方法和组合物。本发明涵盖用于制备基因组DNA的长片段、用于为长片段阅读测序方法加工基因组DNA的方法和组合物及用于加工并分析序列数据的软件和算法。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 片段 阅读 方法 组合 | ||
【主权项】：
一种将双链靶核酸片段化的方法，所述方法包括：(a)提供基因组DNA；(b)将所述DNA分成第一层分开的等分试样；(c)扩增所述分开的等分试样中的所述DNA以形成多个扩增子，其中用dNTP群进行所述扩增，其中所述dNTP群包含：(i)预定的dUTP与dTTP比率，使得所述DNA中的许多胸腺嘧啶被尿嘧啶替换；(ii)预定的5‑甲基dCTP与dCTP比率，使得许多胞嘧啶被5‑甲基胞嘧啶替换；(d)自所述扩增子除去所述尿嘧啶和所述5‑甲基胞嘧啶以形成有缺口的DNA；(e)处理所述有缺口的DNA以平移所述缺口，直至相反链上的缺口会聚，由此创建平端DNA片段，其中与在没有5‑甲基胞嘧啶的情况中生成的片段相比，所述平端片段具有更小的GC偏离和更小的覆盖偏离。
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