[发明专利]用于基因组组装、单元型定相以及独立于靶标的核酸检测的方法

摘要

本公开内容提供了用于组装真核或原核生物体的基因组的方法。本公开内容提供了用于单元型定相和宏基因组组装的方法。本公开内容提供了用于完成这些任务的流畅作业法，使得中间体无需被亲和标记物标记来促进与固体表面的结合。本公开内容还提供了用于从头生成异质宏基因组样品或从多个个体获得的样品中未知生物体的支架信息、连接信息和基因组信息的方法和组合物。所述方法的实施可允许对异质样品中的未培养或未鉴定的生物体的整个基因组进行从头测序，或确定从多个个体获得的包含核酸的样品中的核酸分子的连接信息。

主权项

1.一种测定异质样品中的核酸分子多样性的方法，该方法包括：a)获得包含多样化的多个核酸的稳定化的核酸样品，所述多样化的多个核酸被稳定化，使得对于所述多个核酸中的至少一个成员，第一核酸区段和第二核酸区段独立于它们共同的磷酸二酯骨架而被保持在一起，其中在所述第一核酸区段与所述第二核酸区段之间裂解所述磷酸二酯骨架；b)标记所述第一核酸区段和所述第二核酸区段，使得在由所述多样化的多个核酸的共同核酸产生时，所述第一核酸区段和所述第二核酸区段是可识别的；c)对所述第一核酸区段的至少一个可识别部分及其标记以及所述第二核酸区段的可识别部分及其标记进行测序；d)将所述第一核酸区段和所述第二核酸区段分配给与所述标记对应的支架；使得所述多样化的多个核酸的多个区段被分配给至少一个支架；以及e)确定与生成多少支架对应的数目；其中生成的支架的数目与所述异质样品的核酸分子多样性对应。