[发明专利]核酸酶DSB的完全查询和测序(FIND-SEQ)在审

专利信息
申请号: 201680065929.X 申请日: 2016-09-09
公开(公告)号: CN108350453A 公开(公告)日: 2018-07-31
发明(设计)人: J·K·乔昂格;S·特赛 申请(专利权)人: 通用医疗公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6855
代理公司: 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 代理人: 刘新宇;李茂家
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 提供了一种用于从细胞类型特异性基因组DNA样品中全基因组检测潜在的CRISPR‑Cas9脱靶切割位点的灵敏的无偏方法。
搜索关键词: 特异性基因组 切割位点 全基因组 细胞类型 核酸酶 潜在的 测序 灵敏 查询 检测
【主权项】:
1.一种制备共价闭合DNA片段的文库的方法,该方法包括:提供DNA,优选来自目的细胞类型或生物体的基因组DNA(gDNA);任选地将所述DNA随机剪切至限定的平均长度,优选约200个碱基对至1000个碱基对(bp)的平均长度,以提供DNA片段群;制备用于末端连接的片段,优选地通过对剪切的DNA进行末端修复,并且然后对其加A尾;将至少包含单一脱氧尿苷和第一引物位点的第一发夹衔接子连接至所述片段的末端以制备连接片段群;使所述连接片段与诱导双链断裂的核酸酶接触;以及用外切核酸酶纯化所述连接片段,由此制备共价闭合DNA片段的文库。
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