[发明专利]诊断莱姆病并用于预测治疗后莱姆病螺旋体消除的组合物和方法

摘要

提供组合物和方法，用于对莱姆病(LD)进行检测、诊断和预后，包括确认疏螺旋体(Borrelia spp.)感染的方法，所述方法通过如下方式进行：在体外使来自疑似患有LD的对象的全血样品与多种合成肽接触，所述合成肽包含源自在莱姆病的不同阶段表达的疏螺旋体蛋白的含T细胞表位的区域，和，通过测定响应所述肽的刺激而产生的T细胞免疫应答指示物(例如，干扰素‑γ)的生成来间接地检测LD特异性活化的T细胞。还公开了用于预测已经历LD治疗的LD患者中LD螺旋体的消除的方法，所述方法通过如下方式进行：使来自所述对象的全血样品与包含在莱姆病的不同阶段表达的疏螺旋体蛋白的特定T细胞表位区域的肽接触，和，通过可检测的T细胞免疫应答指示物(例如，干扰素‑γ)的缺乏来确认该样品中缺乏疏螺旋体特异性活化的T细胞。

主权项

一种用于莱姆病的诊断或预后的组合物，其选自第一组合物和第二组合物：(I)第一组合物，其包含：(a)1、2、3、4或5种分离的FlaB肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:1‑5所示的氨基酸序列的FlaB肽，或与SEQ ID NO:1‑5所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体；(b)1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13种分离的DbpB肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:6‑18所示的氨基酸序列的DbpB肽，或与SEQ ID NO:6‑18所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体；(c)1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13种分离的p66肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:19‑31所示的氨基酸序列的p66肽，或与SEQ ID NO:19‑31所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体；和(d)1或2种分离的OspC肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:32‑33所示的氨基酸序列的OspC肽，或与SEQ ID NO:32‑33所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体，其中，所述组合物，在与获自被莱姆病关联的疏螺旋体种类感染的对象的全血接触之后，能够引发T细胞的二次体外免疫应答；和(II)第二组合物，其包含：(a)5种分离的FlaB肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:1‑5所示的氨基酸序列的FlaB肽，或与SEQ ID NO:1‑5所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体；(b)13种分离的DbpB肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:6‑18所示的氨基酸序列的DbpB肽，或与SEQ ID NO:6‑18所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体；(c)13种分离的p66肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:19‑31所示的氨基酸序列的p66肽，或与SEQ ID NO:19‑31所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体；和(d)2种分离的OspC肽，其各自包含疏螺旋体T细胞表位，并且选自具有SEQ ID NO:32‑33所示的氨基酸序列的OspC肽，或与SEQ ID NO:32‑33所示的氨基酸序列具有至少80％氨基酸序列相同性的其一种或多种变体。