[发明专利]多处理器流水线架构在审

专利信息
申请号: 201680036294.0 申请日: 2016-05-05
公开(公告)号: CN107683340A 公开(公告)日: 2018-02-09
发明(设计)人: S·E·赫尔格森;M·米利迪;M·T·拉卡塔;J·N·拉布伦茨 申请(专利权)人: 加利福尼亚太平洋生物科学股份有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;G06F15/82;G06F13/42
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司31100 代理人: 陈洁,姬利永
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 一种将来自测序样本采集的信号转换为序列数据的多处理器流水线架构,其包括定制协处理器卡,其配置为直接接收由图像传感器产生的串行传感器数据流,其中所述传感器数据表示构成所述图像传感器的像素的逐帧强度值;第一协处理器,其连续地接收所述串行传感器数据流并将所述逐帧强度值转置为反应单元组块;缓冲器,其重复地接收所述反应单元组块并在连续存储器位置存储较大预定时间窗口内每个相应反应单元的所述反应单元组块,以产生较大反应单元组块;以及多个第二协处理器,其检索来自所述缓冲器的所述较大反应单元组块,并且并行地将所述像素强度值转换为逐碱基序列数据。
搜索关键词: 处理器 流水线 架构
【主权项】:
一种将来自测序样本采集的信号转换为序列数据的多处理器流水线架构,其包括:定制协处理器卡,其配置为直接接收由图像传感器产生的串行传感器数据流,其中所述传感器数据表示构成所述图像传感器的像素的逐帧强度值,其中所述图像传感器捕获从可移除集成测序芯片的多个反应单元发射的光的图像;第一协处理器,其连续地接收所述串行传感器数据流并将所述逐帧强度值转置为反应单元组块,每个所述反应单元组块表示预定时间窗口内对应反应单元的跨帧的像素强度值的影片数据;缓冲器,其重复地接收所述反应单元组块并在连续存储器位置存储较大预定时间窗口内每个相应反应单元的所述反应单元组块,以产生较大反应单元组块;以及多个第二协处理器,其检索来自所述缓冲器的较大反应单元组块,并且即使在所述缓冲器接收另外的反应单元组块时,也并行地将所述像素强度值转换为逐碱基序列数据,使得在获得用于所述测序样本采集的所有传感器数据之前,所述第二协处理器开始原始碱基识别。
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