[发明专利]一种玉米纹枯病菌SSR标记及其制备方法、应用有效

专利信息
申请号: 201610841026.8 申请日: 2016-09-22
公开(公告)号: CN106399508B 公开(公告)日: 2019-12-10
发明(设计)人: 王玲;黄世文;刘连盟 申请(专利权)人: 中国水稻研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 33213 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 代理人: 沈渊琪
地址: 311401 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种玉米纹枯病菌SSR标记及其制备方法、应用,属于分子生物技术领域。该玉米纹枯病菌SSR标记包括了8组引物对,该标记的制备方法包括:1)提取玉米纹枯病菌的基因组DNA;2)利用限制性内切酶酶切总DNA,获得DNA片段;3)生物素标记的探针与目的片段杂交;4)利用磁珠对含有SSR序列的DNA片段进行富集;5)对含有SSR序列的DNA片段进行扩增并纯化;6)将DNA片段进行克隆测序;7)根据SSR的侧翼序列设计SSR引物,用于扩增该位点的微卫星片段。本发明引物特异性高、扩增稳定、操作简便,周期短、成本低,同时,SSR标记自身具有共显性遗传、多态性丰富的优点,能够用于玉米纹枯病菌遗传多样性的分析。
搜索关键词: 玉米纹枯病菌 扩增 制备 分子生物技术 限制性内切酶 生物素标记 微卫星片段 遗传多样性 引物特异性 基因组DNA 侧翼序列 克隆测序 目的片段 多态性 共显性 总DNA 磁珠 富集 酶切 探针 位点 引物 遗传 杂交 应用 分析
【主权项】:
1.一种玉米纹枯病菌SSR标记引物,其特征在于包括引物对MA1、MA3、MA4、MA8、MA10、MA11、MA12和MA14,所述的引物对MA1包括引物MA1F和引物MA1R,所述的引物对MA3包括引物MA3F和引物MA3R,所述的引物对MA4包括引物MA4F和引物MA4R,所述的引物对MA8包括引物MA8F和引物MA8R,所述的引物对MA10包括引物MA10F和引物MA10R,所述的引物对MA11包括引物MA11F和引物MA11R,所述的引物对MA12包括引物MA12F和引物MA12R,所述的引物对MA14包括引物MA14F和引物MA14R,/n所述的MA1F的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,/n所述的MA1R的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,/n所述的MA3F的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,/n所述的MA3R的核苷酸序列如 SEQ ID No.6所示,/n所述的MA4F的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示,/n所述的MA4R的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示,/n所述的MA8F的核苷酸序列如SEQ ID No.15所示,/n所述的MA8R的核苷酸序列如SEQ ID No.16所示,/n所述的MA10F的核苷酸序列如SEQ ID No.19所示,/n所述的MA10R的核苷酸序列如SEQ ID No.20所示,/n所述的MA11F的核苷酸序列如SEQ ID No.21所示,/n所述的MA11R的核苷酸序列如SEQ ID No.22所示,/n所述的MA12F的核苷酸序列如SEQ ID No.23所示,/n所述的MA12R的核苷酸序列如SEQ ID No.24所示,/n所述的MA14F的核苷酸序列如SEQ ID No.27所示,/n所述的MA14R的核苷酸序列如SEQ ID No.28所示。/n
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