[发明专利]一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统有效

专利信息
申请号: 201610542734.1 申请日: 2016-07-11
公开(公告)号: CN107038350B 公开(公告)日: 2020-06-05
发明(设计)人: 王永翠;王勇 申请(专利权)人: 中国科学院数学与系统科学研究院;中国科学院西北高原生物研究所
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30
代理公司: 北京君尚知识产权代理有限公司 11200 代理人: 邱晓锋
地址: 100190 *** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明涉及一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统。该方法包括:1)通过分析长非编码RNA和基因的表达数据构建长非编码RNA和基因的共表达关系,并通过机器学习方法预测长非编码RNA的调控基因集合;2)通过分析药物作用下的基因表达数据构建对药物敏感的基因集合;3)通过最优化方法建立长非编码RNA的调控基因和药物敏感基因的联系,进而预测药物的长非编码RNA靶点。该系统包括数据收集模块、数据集构建模块、数据建模模块。本发明建立了一种全新的基于最优化模型的药物长非编码RNA靶点的识别框架和计算系统,能够有效预测药物长非编码RNA靶点。
搜索关键词: 一种 药物 编码 rna 预测 方法 系统
【主权项】:
一种药物的长非编码RNA靶点预测方法,其特征在于,包括以下步骤:1)通过分析长非编码RNA和基因的表达数据构建长非编码RNA和基因的共表达关系,并通过机器学习方法预测长非编码RNA的调控基因集合;2)通过分析药物作用下的基因表达数据构建对药物敏感的基因集合;3)通过最优化方法建立长非编码RNA的调控基因和药物敏感基因的联系,进而预测药物的长非编码RNA靶点。
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