[发明专利]一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统有效
申请号: | 201610542734.1 | 申请日: | 2016-07-11 |
公开(公告)号: | CN107038350B | 公开(公告)日: | 2020-06-05 |
发明(设计)人: | 王永翠;王勇 | 申请(专利权)人: | 中国科学院数学与系统科学研究院;中国科学院西北高原生物研究所 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30 |
代理公司: | 北京君尚知识产权代理有限公司 11200 | 代理人: | 邱晓锋 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统。该方法包括:1)通过分析长非编码RNA和基因的表达数据构建长非编码RNA和基因的共表达关系,并通过机器学习方法预测长非编码RNA的调控基因集合;2)通过分析药物作用下的基因表达数据构建对药物敏感的基因集合;3)通过最优化方法建立长非编码RNA的调控基因和药物敏感基因的联系,进而预测药物的长非编码RNA靶点。该系统包括数据收集模块、数据集构建模块、数据建模模块。本发明建立了一种全新的基于最优化模型的药物长非编码RNA靶点的识别框架和计算系统,能够有效预测药物长非编码RNA靶点。 | ||
搜索关键词: | 一种 药物 编码 rna 预测 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种药物的长非编码RNA靶点预测方法,其特征在于,包括以下步骤:1)通过分析长非编码RNA和基因的表达数据构建长非编码RNA和基因的共表达关系,并通过机器学习方法预测长非编码RNA的调控基因集合;2)通过分析药物作用下的基因表达数据构建对药物敏感的基因集合;3)通过最优化方法建立长非编码RNA的调控基因和药物敏感基因的联系,进而预测药物的长非编码RNA靶点。
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