[发明专利]一种水体中微生物DNA的提取方法在审

专利信息
申请号: 201610119545.3 申请日: 2016-03-03
公开(公告)号: CN107151666A 公开(公告)日: 2017-09-12
发明(设计)人: 李鹏;唐雪明;潘爱虎;赵凯;蒋玮;王金斌;武国干;吕贝贝;吴潇;贾军伟;王荣谈;白蓝;刘华;王慧 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司31114 代理人: 费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 一种水体中微生物DNA的提取方法,采用无菌微孔滤膜收集微生物,利用物理和化学方法破碎微生物细胞,其次采用醋酸钾、异硫氰酸胍、柠檬酸钠等试剂去除腐殖酸等杂质,将细胞裂解液进行多次离心纯化,最后用乙醇和醋酸钾抽提后得到纯化的微生物基因组DNA,所提取的微生物DNA具有较好的完整性,纯度高,产量高,其OD260/OD280比值在1.8~2.0之间,经琼脂糖凝胶电泳后染色,DNA条带清晰且单一,无拖尾,无杂带,获得的微生物DNA产量高、操作简单、成本低,提取过程无需再纯化,缩减了提取步骤,降底了提取成本,适用于各种水体微生物的多样性分析。
搜索关键词: 一种 水体 微生物 dna 提取 方法
【主权项】:
一种水体中微生物DNA的提取方法,包括如下步骤:1)收集微生物将水样经微孔滤膜过滤,收集滤膜,在无菌条件下,将滤膜剪碎,放入离心管;2)破碎微生物细胞向步骤1)的离心管中加入氧化锆、试剂I、试剂II,震荡,离心,取上清液;其中,所述的试剂I为0.2~0.3M磷酸缓冲液,pH=7.0~8.0;所述的试剂II包括:1~2wt.%SDS细胞裂解液,20~60mM Tris‑HCl,100~200mM NaCl,40~100mM EDTA,0.1~1wt.%乙烯聚吡咯烷酮,pH=7.8~8.0;3)去除腐殖酸和蛋白质向步骤2)的上清液中加入试剂III,混匀,离心,向离心后的上清液中加入试剂IV,混匀,离心,得到裂解液;其中,所述的试剂III为80~120mM硫酸铝;所述的试剂IV中含有浓度为2~5M的醋酸钾、2~6wt.%的冰醋酸,pH=4.6~5.0;4)纯化裂解液将裂解液的上清液中加入试剂V,混匀,移入核酸纯化柱中,静置,离心,弃去虑液;向核酸纯化柱中加入试剂VI纯化,离心,弃去滤液,再加试剂VII纯化,离心,弃去滤液;其中,利用试剂VII纯化2~3次;其中,所述的试剂V中含有:6~10M异硫氰酸胍,0.2~0.6M醋酸钾;所述的试剂VI中含有:6~10M异硫氰酸胍,20~23mM柠檬酸钠;所述的试剂VII中含有:70~75%乙醇,体积分数;5)洗脱DNA将核酸纯化柱安置于离心管内,离心,向核酸纯化柱中加入灭菌蒸馏水,室温静置,将静置后获得的洗脱液进行离心,获得所述微生物DNA。
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