[发明专利]一种水体中微生物DNA的提取方法在审

专利信息
申请号: 201610119545.3 申请日: 2016-03-03
公开(公告)号: CN107151666A 公开(公告)日: 2017-09-12
发明(设计)人: 李鹏;唐雪明;潘爱虎;赵凯;蒋玮;王金斌;武国干;吕贝贝;吴潇;贾军伟;王荣谈;白蓝;刘华;王慧 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司31114 代理人: 费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 水体 微生物 dna 提取 方法
【权利要求书】:

1.一种水体中微生物DNA的提取方法,包括如下步骤:

1)收集微生物

将水样经微孔滤膜过滤,收集滤膜,在无菌条件下,将滤膜剪碎,放入离心管;

2)破碎微生物细胞

向步骤1)的离心管中加入氧化锆、试剂I、试剂II,震荡,离心,取上清液;

其中,所述的试剂I为0.2~0.3M磷酸缓冲液,pH=7.0~8.0;所述的试剂II包括:1~2wt.%SDS细胞裂解液,20~60mM Tris-HCl,100~200mM NaCl,40~100mM EDTA,0.1~1wt.%乙烯聚吡咯烷酮,pH=7.8~8.0;

3)去除腐殖酸和蛋白质

向步骤2)的上清液中加入试剂III,混匀,离心,向离心后的上清液中加入试剂IV,混匀,离心,得到裂解液;

其中,所述的试剂III为80~120mM硫酸铝;所述的试剂IV中含有浓度为2~5M的醋酸钾、2~6wt.%的冰醋酸,pH=4.6~5.0;

4)纯化裂解液

将裂解液的上清液中加入试剂V,混匀,移入核酸纯化柱中,静置,离心,弃去虑液;向核酸纯化柱中加入试剂VI纯化,离心,弃去滤液,再加试剂VII纯化,离心,弃去滤液;其中,利用试剂VII纯化2~3次;

其中,所述的试剂V中含有:6~10M异硫氰酸胍,0.2~0.6M醋酸钾;所述的试剂VI中含有:6~10M异硫氰酸胍,20~23mM柠檬酸钠;所述的试剂VII中含有:70~75%乙醇,体积分数;

5)洗脱DNA

将核酸纯化柱安置于离心管内,离心,向核酸纯化柱中加入灭菌蒸馏水,室温静置,将静置后获得的洗脱液进行离心,获得所述微生物DNA。

2.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,步骤2)中所述氧化锆粒径为:1.0~1.2mm。

3.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,所述试剂II中包括:1.4~1.6wt.%SDS细胞裂解液,30~50mM Tris-HCl,140~160mM NaCl,60~80mM EDTA,0.4~0.6wt.%乙烯聚吡咯烷酮,PH=7.85~7.95。

4.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,步骤4)所述的核酸纯化柱是含有聚丙烯膜+硅胶膜的核酸纯化柱。

5.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,所述试剂III为90~110mM硫酸铝。

6.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,所述试剂IV包括:3~4M的醋酸钾、3~5wt.%的冰醋酸,PH=4.7~4.9。

7.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,步骤5)中洗脱DNA时,灭菌蒸馏水加热至60~65℃。

8.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,还包括将获得的微生物DNA保存于-20~-18℃。

9.根据权利要求1-8任一项所述的水体中微生物的提取方法,其特征在于,所述水样的体积为50~100ml,所述的氧化锆的加入量为0.8~1.0g,水样和试剂I的体积比为40~50:1。

10.根据权利要求9所述的水体中微生物的提取方法,其特征在于,所述的试剂I、试剂II、试剂III、试剂IV、试剂V、试剂VI和试剂VII之间的体积比为1:0.15~0.2:0.15~0.2:0.3~0.4:1~1.2:0.4~0.6:0.4~0.6。

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