[发明专利]一种水体中微生物DNA的提取方法在审
| 申请号: | 201610119545.3 | 申请日: | 2016-03-03 |
| 公开(公告)号: | CN107151666A | 公开(公告)日: | 2017-09-12 |
| 发明(设计)人: | 李鹏;唐雪明;潘爱虎;赵凯;蒋玮;王金斌;武国干;吕贝贝;吴潇;贾军伟;王荣谈;白蓝;刘华;王慧 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司31114 | 代理人: | 费开逵 |
| 地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
| 权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 水体 微生物 dna 提取 方法 | ||
1.一种水体中微生物DNA的提取方法,包括如下步骤:
1)收集微生物
将水样经微孔滤膜过滤,收集滤膜,在无菌条件下,将滤膜剪碎,放入离心管;
2)破碎微生物细胞
向步骤1)的离心管中加入氧化锆、试剂I、试剂II,震荡,离心,取上清液;
其中,所述的试剂I为0.2~0.3M磷酸缓冲液,pH=7.0~8.0;所述的试剂II包括:1~2wt.%SDS细胞裂解液,20~60mM Tris-HCl,100~200mM NaCl,40~100mM EDTA,0.1~1wt.%乙烯聚吡咯烷酮,pH=7.8~8.0;
3)去除腐殖酸和蛋白质
向步骤2)的上清液中加入试剂III,混匀,离心,向离心后的上清液中加入试剂IV,混匀,离心,得到裂解液;
其中,所述的试剂III为80~120mM硫酸铝;所述的试剂IV中含有浓度为2~5M的醋酸钾、2~6wt.%的冰醋酸,pH=4.6~5.0;
4)纯化裂解液
将裂解液的上清液中加入试剂V,混匀,移入核酸纯化柱中,静置,离心,弃去虑液;向核酸纯化柱中加入试剂VI纯化,离心,弃去滤液,再加试剂VII纯化,离心,弃去滤液;其中,利用试剂VII纯化2~3次;
其中,所述的试剂V中含有:6~10M异硫氰酸胍,0.2~0.6M醋酸钾;所述的试剂VI中含有:6~10M异硫氰酸胍,20~23mM柠檬酸钠;所述的试剂VII中含有:70~75%乙醇,体积分数;
5)洗脱DNA
将核酸纯化柱安置于离心管内,离心,向核酸纯化柱中加入灭菌蒸馏水,室温静置,将静置后获得的洗脱液进行离心,获得所述微生物DNA。
2.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,步骤2)中所述氧化锆粒径为:1.0~1.2mm。
3.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,所述试剂II中包括:1.4~1.6wt.%SDS细胞裂解液,30~50mM Tris-HCl,140~160mM NaCl,60~80mM EDTA,0.4~0.6wt.%乙烯聚吡咯烷酮,PH=7.85~7.95。
4.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,步骤4)所述的核酸纯化柱是含有聚丙烯膜+硅胶膜的核酸纯化柱。
5.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,所述试剂III为90~110mM硫酸铝。
6.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,所述试剂IV包括:3~4M的醋酸钾、3~5wt.%的冰醋酸,PH=4.7~4.9。
7.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,步骤5)中洗脱DNA时,灭菌蒸馏水加热至60~65℃。
8.根据权利要求1所述的水体中微生物DNA的提取方法,其特征在于,还包括将获得的微生物DNA保存于-20~-18℃。
9.根据权利要求1-8任一项所述的水体中微生物的提取方法,其特征在于,所述水样的体积为50~100ml,所述的氧化锆的加入量为0.8~1.0g,水样和试剂I的体积比为40~50:1。
10.根据权利要求9所述的水体中微生物的提取方法,其特征在于,所述的试剂I、试剂II、试剂III、试剂IV、试剂V、试剂VI和试剂VII之间的体积比为1:0.15~0.2:0.15~0.2:0.3~0.4:1~1.2:0.4~0.6:0.4~0.6。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海市农业科学院,未经上海市农业科学院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201610119545.3/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种人外泌体蛋白、试剂盒及其应用
- 下一篇:一种基因组DNA提取方法





