[发明专利]预测针对嵌合抗原受体疗法的治疗应答性的生物标志及其用途

摘要

公开了癌症生物标志及其使用方法。

主权项

评估患有癌症的受试者，例如评估或监测患有癌症的受试者中CAR表达细胞疗法的有效性的方法，其包括:为所述受试者获得对包含CAR表达细胞群体(例如，CAR19表达细胞群体)的疗法的应答者或者复发者状态的值，其中所述应答者或复发者状态的值包括测量以下一项，两项，三项，四项，五项，六项，七项，或更多(全部)项:(i)样品(例如，单采血液成分术样品或制造的CAR表达细胞产物样品)中例如CD4+或CD8+T细胞群中CD27和/或CD45RO‑(例如，CD27+CD45RO‑)免疫效应细胞的水平或活性；(ii)样品(例如，单采血液成分术样品或制造的CAR表达细胞产物样品)中静息的TEFF细胞，静息的TREG细胞，较年轻的T细胞(例如较年轻的CD4或CD8细胞或γ/δT细胞)，或早期记忆T细胞或其组合的一种，两种，三种或更多种(例如，全部)的水平或活性；(iii)样品(例如，单采血液成分术样品或制造的CAR表达细胞产物样品)中活化的TEFF细胞，活化的TREG细胞，较老T细胞(例如较老的CD4或CD8细胞)或晚期记忆T细胞或其组合的一种，两种，三种或更多种(例如，全部)的水平或活性；(iv)样品(例如，单采血液成分术样品或制造的CAR表达细胞产物样品)中免疫细胞耗尽标志例如一种，两种或更多种免疫检查点抑制剂(例如，PD‑1，TIM‑3和/或LAG‑3)的水平或活性；(v)表1A，表1B，表7A，表7B，表8，表9，表10，表14(例如CCL20，IL‑17a和/或IL‑6)，表16，表17，表18，表20，图2B，PD‑1，LAG‑3，TIM‑3，CD57，CD27，CD122，CD62L，KLRG1或CD19CAR表达细胞基因集特征中列出的一种，两种，三种，四种，五种，十种，二十种或更多种生物标志的水平或活性；(vi)CAR表达细胞产物样品,例如CAR19表达细胞产物样品(例如，CTL019)中的细胞因子水平或活性(例如，细胞因子所有组成成分的质量)，其中细胞因子选自表16中所列细胞因子的一种，两种，三种，四种，五种或更多种(或全部)；(vii)制造的CAR表达细胞产物样品中CAR表达细胞的转导效率；或(viii)样品(例如，单采血液成分术样品或CAR表达细胞产物样品，例如CAR19表达细胞产物样品(例如，CTL019))中CD27+PD‑1‑细胞的量，例如大于或等于1x107个细胞的量,其中所述值表示受试者对CAR表达细胞疗法的应答性或复发状态，从而评估所述受试者。