[发明专利]一种DNA测序的图像识别的预处理方法及装置

摘要

本发明涉及一种DNA测序的图像识别的预处理方法及装置，方法包括:获取图谱信息，在对每个图谱的取样时间间隔内分别获取DNA图谱；对所述图谱进行灰度线性拉伸，获得拉伸后的DNA图谱；获取所述拉伸后DNA图谱的第一像素A和第二像素B；计算第一像素A和第二像素B的灰度均值的全局阈值T；计算第一像素A和第二像素B的方差σ²；若方差σ²在预设范围内，则以T为全局阈值对所述图谱进行分割。可以实现在对反应芯片的图像采集时，使目标和背景容易识别，避免目标的误识别，且运行时间短，对图像分割效果好，提高对反应芯片的图像采集后，对图像识别的准确性，进而精确对碱基类型的判定。

主权项

一种DNA测序的图像识别的预处理方法，其特征在于，包括：获取图谱信息，在对每个图谱的取样时间间隔内分别获取DNA图谱；对所述图谱进行灰度线性拉伸，获得拉伸后的DNA图谱；获取所述拉伸后DNA图谱的第一像素和第二像素,其中,第一像素A为目标像素,第一像素A的灰度值大于或等于初始分割阈值T₀,像素总数为N；第二像素B为背景像素,第二像素B的灰度值小于初始分割阈值T₀,像素总数为M；拉伸后的DNA图谱矩阵f(i,j)的最大值为V_max，最小值为V_min；其中，T₀＝1/2(V_min+V_max)   (1)；计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T：$T=1/2(\frac{\underset{f(i,j)\≥T_0}{\Σ}f(i,j)}{N}+\frac{\underset{f(i,j)\<T_0}{\Σ}f(i,j)}{M})---\left(2\right);$计算第一像素A和第二像素B的方差σ²：σ²＝(P_A+P_B)(T‑T₀)²   (3)；其中，第一像素A的概率为：$P_A=\underset{k=1}{\overset{M+N}{\Σ}}\frac{N}{M+N}---\left(4\right);$第二像素B的概率为：$P_B=\underset{k=1}{\overset{M+N}{\Σ}}\frac{M}{M+N}---\left(5\right);$若方差σ²在预设范围内，则以T为全局阈值对所述拉伸后的DNA图谱进行分割。