[发明专利]一种DNA测序的图像识别的预处理方法及装置有效

专利信息
申请号: 201510909564.1 申请日: 2015-12-10
公开(公告)号: CN105551034B 公开(公告)日: 2018-06-05
发明(设计)人: 刘元杰;陈哲;张睿;范东雨;高科;王者馥;王绪敏;殷金龙;任鲁风 申请(专利权)人: 北京中科紫鑫科技有限责任公司
主分类号: G06T7/30 分类号: G06T7/30;G06T7/10;G06T7/136;G06T7/194;G06F19/20
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地址: 101111 北京市大兴区经济技术*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 像素 图像识别 拉伸 预处理 图谱 反应芯片 图像采集 方差 取样时间间隔 灰度线性 碱基类型 图谱信息 图像分割 误识别 灰度 预设 全局 判定 分割
【权利要求书】:

1.一种DNA测序的图像识别的预处理方法,其特征在于,包括:

获取图谱信息,在对每个图谱的取样时间间隔内分别获取DNA图谱;

对所述图谱进行灰度线性拉伸,获得拉伸后的DNA图谱;

获取所述拉伸后DNA图谱的第一像素和第二像素,其中,第一像素A为目标像素,第一像素A的灰度值大于或等于初始分割阈值T0,像素总数为N;第二像素B为背景像素,第二像素B的灰度值小于初始分割阈值T0,像素总数为M;拉伸后的DNA图谱矩阵f(i,j)的最大值为Vmax,最小值为Vmin

其中,T0=1/2(Vmin+Vmax) (1);

计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T:

T = 1 / 2 ( Σ f ( i , j ) ≥ T 0 f ( i , j ) N + Σ f ( i , j ) < T 0 f ( i , j ) M ) - - - ( 2 ) ; ]]>

计算第一像素A和第二像素B的方差σ2

σ2=(PA+PB)(T-T0)2 (3);

其中,第一像素A的概率为:

P A = Σ k = 1 M + N N M + N - - - ( 4 ) ; ]]>

第二像素B的概率为:

P B = Σ k = 1 M + N M M + N - - - ( 5 ) ; ]]>

若方差σ2在预设范围内,则以T为全局阈值对所述拉伸后的DNA图谱进行分割。

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