[发明专利]一种DNA测序的图像识别的预处理方法及装置有效
| 申请号: | 201510909564.1 | 申请日: | 2015-12-10 |
| 公开(公告)号: | CN105551034B | 公开(公告)日: | 2018-06-05 |
| 发明(设计)人: | 刘元杰;陈哲;张睿;范东雨;高科;王者馥;王绪敏;殷金龙;任鲁风 | 申请(专利权)人: | 北京中科紫鑫科技有限责任公司 |
| 主分类号: | G06T7/30 | 分类号: | G06T7/30;G06T7/10;G06T7/136;G06T7/194;G06F19/20 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 101111 北京市大兴区经济技术*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 像素 图像识别 拉伸 预处理 图谱 反应芯片 图像采集 方差 取样时间间隔 灰度线性 碱基类型 图谱信息 图像分割 误识别 灰度 预设 全局 判定 分割 | ||
1.一种DNA测序的图像识别的预处理方法,其特征在于,包括:
获取图谱信息,在对每个图谱的取样时间间隔内分别获取DNA图谱;
对所述图谱进行灰度线性拉伸,获得拉伸后的DNA图谱;
获取所述拉伸后DNA图谱的第一像素和第二像素,其中,第一像素A为目标像素,第一像素A的灰度值大于或等于初始分割阈值T0,像素总数为N;第二像素B为背景像素,第二像素B的灰度值小于初始分割阈值T0,像素总数为M;拉伸后的DNA图谱矩阵f(i,j)的最大值为Vmax,最小值为Vmin;
其中,T0=1/2(Vmin+Vmax) (1);
计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T:
计算第一像素A和第二像素B的方差σ2:
σ2=(PA+PB)(T-T0)2 (3);
其中,第一像素A的概率为:
第二像素B的概率为:
若方差σ2在预设范围内,则以T为全局阈值对所述拉伸后的DNA图谱进行分割。
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