[发明专利]一种针对特定大小RNA片段的高通量测序文库构建方法在审

专利信息
申请号: 201510707080.9 申请日: 2015-10-27
公开(公告)号: CN105200531A 公开(公告)日: 2015-12-30
发明(设计)人: 郑洪坤;刘慧;郭强;方涛 申请(专利权)人: 北京百迈客生物科技有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/68
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君
地址: 101300 北京市顺*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种针对特定大小RNA片段的高通量测序文库构建方法,包括以下步骤:去除总RNA中的DNA;去除总RNA中的rRNA;聚丙烯酰胺凝胶电泳切胶筛选目的大小的RNA;在RNA的3’端连接3’接头;以RNA为模板,加入与3’接头反向互补的逆转录引物进行退火,使3’接头与逆转录引物结合;在RNA的5’端连接5’接头;以RNA为模板,进行逆转录;使用逆转录引物与Index引物进行PCR反应,获得测序文库。上述方法能够去除DNA污染和rRNA对测序数据的影响,同时增加了聚丙烯酰胺凝胶电泳切胶,达到获取特定大小片段的目的。该方法可广泛用于包括原核小RNA在内的特定大小RNA片段的高通量测序。
搜索关键词: 一种 针对 特定 大小 rna 片段 通量 序文 构建 方法
【主权项】:
一种针对特定大小RNA片段的高通量测序文库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)去除总RNA中的DNA;(2)去除总RNA中的rRNA序列;(3)使用聚丙烯酰胺凝胶电泳切胶筛选目的大小的RNA;(4)在目的大小的RNA的3’端连接3’接头;以RNA为模板,加入与3’接头反向互补的逆转录引物进行退火,使3’接头与逆转录引物结合;(5)在RNA的5’端连接5’接头;以RNA为模板,进行逆转录;(6)使用P5引物与Index引物进行PCR反应,获得测序文库。
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