[发明专利]一种检测污水中亚硝酸盐氧化菌群落结构和丰度的方法在审
| 申请号： | 201510031461.X | 申请日： | 2015-01-22 |
| 公开（公告）号： | CN104745684A | 公开（公告）日： | 2015-07-01 |
| 发明（设计）人： | 刘波;王德朋;陆鑫;丁新春;侯翔宇;姚芳;周德超;李爱民;李睿华 | 申请（专利权）人： | 南京大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 江苏圣典律师事务所 32237 | 代理人： | 贺翔;杨文晰 |
| 地址： | 210093 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开一种测污水中亚硝酸盐氧化菌群落结构和丰度的方法，具体步骤为：（a）提取污水中活性污泥的全部基因组DNA；（b）分别对nxrA基因和nxrB基因进行PCR扩增；（c）以罗氏454焦磷酸测序法分别对扩增产物进行测序；（d）对测序结果划分操作分类单元；（e）选取具有97%相似度的操作分类单元序列进行BLASTn比对，利用MEGA软件分别对nxrA基因和nxrB基因划分系统进化树，即为污水中亚硝酸盐氧化菌的群落结构；nxrA基因和nxrB基因的不同操作分类单元的相对丰度即为污水中亚硝酸盐氧化菌的丰度；该方法操作简便，检测范围广，既可应用于实验室的检测分析，也可以实现对污水厂脱氮效率的实时监测。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 检测 污水 中亚 硝酸盐 氧化 群落 结构 方法 | ||
【主权项】：
一种检测污水中亚硝酸盐氧化菌群落结构和丰度的方法，其特征在于，具体步骤如下：a)提取污水中活性污泥的全部基因组DNA；b)以全部基因组DNA为模板，以上游引物序列SEQ ID No.1和下游引物序列SEQ ID No.2进行nxrA基因PCR扩增；以全部基因组DNA为模板，以上游引物序列SEQ ID No.3下游引物序列SEQ ID No.4进行nxrB基因PCR扩增；c)以罗氏454焦磷酸测序法分别nxrA基因PCR扩增产物和nxrB基因PCR扩增产物进行测序；d）采用Mothur软件分别对nxrA基因PCR扩增产物测序结果和nxrB基因PCR扩增产物测序结果划分操作分类单元；e）选取具有97%相似度的操作分类单元序列与GenBank进行BLASTn比对，根据BLASTn比对结果，选择相似度＞95%的序列，利用MEGA软件分别对nxrA基因和nxrB基因划分系统进化树，即为污水中亚硝酸盐氧化菌的群落结构；nxrA基因和nxrB基因的不同操作分类单元的相对丰度即为污水中亚硝酸盐氧化菌的丰度。
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