[发明专利]PARADIGM药物响应网络有效
申请号: | 201480042609.3 | 申请日: | 2014-05-28 |
公开(公告)号: | CN105556523B | 公开(公告)日: | 2017-07-11 |
发明(设计)人: | S.C.本斯;C.塞托 | 申请(专利权)人: | 凡弗3基因组有限公司 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司72001 | 代理人: | 张凌苗,王传道 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 提出了其中来自多个细胞或组织样本的组学数据被用来识别与细胞或组织的治疗参数(例如,对于特定药物的抗性)相关联的通路元素的系统和方法。然后在统计因子图模型中硅中调制这样识别的通路元素以提供被相对于治疗参数重新评估的已修改数据集。此类系统和模型对针对治疗中心病人的多药物治疗的推荐特别有用。 | ||
搜索关键词: | paradigm 药物 响应 网络 | ||
【主权项】:
一种对从细胞的组学数据导出的数据集进行硅中分析的方法,包括:将通路模型数据库信息地耦合到机器学习系统和通路分析引擎;其中,所述通路模型数据库存储分别地从多个不同有病细胞的组学数据导出的多个不同数据集,并且其中,每个不同数据集包括多个通路元素数据;由机器学习系统接收所述多个不同数据集;由机器学习系统来识别所述多个不同数据集中与有病细胞的治疗参数的状态相关联的决定性通路元素;由通路分析引擎接收来自有病细胞的所述多个不同数据集中的至少一个不同数据集;由通路分析引擎来调制所述至少一个不同数据集中的决定性通路元素以从有病细胞产生已修改数据集;以及由机器学习系统使用已修改数据集来识别针对有病细胞的治疗参数的状态方面的变化。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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