[发明专利]胃癌的预后预测模型的建立方法

摘要

本发明涉及能够预测胃癌的预后的新型预后预测模型的建立方法，更具体地，本发明涉及通过基因突变比较分析来预测经过胃切除术后的临床结果的预测模型。

主权项

一种用于提供信息，以建立用于被诊断为胃癌的受试者的预后预测模型的方法，该方法包括如下步骤：选择可显示与胃癌相关的mRNA差异表达的预后相关基因组，然后分类成mRNA高表达组和mRNA低表达组，与包含从受试者收集的癌细胞的生物样品中的mRNA表达的中位数相比，mRNA高表达组显示出1.5倍以上的增加的差异，mRNA低表达组显示出1.5倍以上的减少的差异，然后测量单核苷酸多态性是否在人KRAS、MET和PIK3CA基因中表达；和通过将所述单核苷酸多态性的表达频率转化为百分比，以获得3％或7％，来确定统计显著性的设定值范围，然后根据所述设定值范围，从总生存(OS)的角度上分类良好预后组和不良预后组，其中，当人KRAS和PIK3CA基因的单核苷酸多态性的所述表达频率超过3％，且MET基因的单核苷酸多态性的所述表达频率等于或小于7％时，可以将其分类为良好预后组，和当人KRAS和PIK3CA基因的单核苷酸多态性的所述表达频率等于或小于3％，且MET基因的单核苷酸多态性的所述表达频率超过7％时，可将其分类为不良预后组，其中所述良好预后组具有与TNM分期无关的整体胃切除术后对于总生存(OS)增加的5至10年时期的积极临床结果的可能性，所述不良预后组具有与TNM分期无关的整体胃切除术后对于总生存(OS)减少的5至10年时期的积极临床结果的可能性，和人KRAS的单核苷酸多态性为选自A146PT_g436ca、G10R_g28a、G12DAV_g35act、G12SRC_g34act、G13DAV_g38act、G13SRC_g37act、Q61EK_c181ga、Q61HHE_a183ctg和Q61LPR_a182tct中的至少一种；人MET的单核苷酸多态性为选自H1112L_a3335t、H1112Y_c3334t、M1268T_t3803c、N375S_a1124g、R988C_c2962t、T1010I_c3029t、Y1248HD_t3742cg和Y1253D_t3757g中的至少一种；和人PIK3CA的单核苷酸多态性为选自A1046V_c3137t、C420R_t1258c、E110K_g328a、E418K_g1252a、E453K_g1357a、E542KQ_g1624ac、E542VG_a1625tg、E545AGV_a1634cgt、E545D_g1635ct、E545KQ_g1633ac、F909L_c2727g、G1049R_g3145c、H1047RL_a3140gt、H1047RL_a3140gt、H1047RL_a3140gt、H1047Y_c3139t、H701P_a2102c、K111N_g333c、M1043I_g3129atc、M1043V_a3127g、N345K_t1035a、P539R_c1616g、Q60K_c178a、Q546EK_c1636ga、Q546LPR_a1637tcg、R88Q_g263a、S405F_c1214t、T1025SA_a3073tg、Y1021C_a3062g和Y1021HN_t3061ca中的至少一种，其中，大写字母表示氨基酸首字母符号，小写字母表示碱基，数字表示碱基或氨基酸残基的位置。