[发明专利]用于预测局部晚期胃癌预后的系统

摘要

本发明涉及可预测局部晚期胃癌的预后的新型预后预测系统，更具体地，本发明可以通过对基因集的表达进行比较分析来预测经过胃癌切除术后的临床结果。

主权项

一种计算机可读的记录媒体，该记录媒体中记录有用于运行无淋巴结转移的N0期胃癌的预后预测的程序，所述程序使得计算机运行如下步骤的程序：从患者采集的核酸样本中确定GART、PTN、PCNA、GLI3、SMARCD3、SULT1A3、ILK、FUCA1、PKD1、TOP2A、ABL1、CKS2、FZD1、TIAL1、SGCD、PIGF、CCNB1、CSK、CRYAB、TPM1、RFC4、GUCY1B3、TYMS、FEN1、GNAI1、CSRP1、UNG、AXL、MAP1B、VCL、ITGA5、LIG1、HPRT1、GRB2、HMMR、MCM4、SRF、DMPK、ACP5、CD38、PRIM1、CCNF、GLRB、IFNAR2、HSPA2、CLN3、BUB1、CALM1、CDC2、ATF4和RRM1的RNA转录本的表达水平并且将RNA的表达水平输入所述程序中；执行所述程序并且接着基于上述步骤中所确定的RNA的表达水平，通过以下公式1和2计算风险分数(RS)和RS百分比(RS(％))，并从胃癌手术切除术后总生存(OS)的角度上，当所述RS(％)的设定值范围为50％或以上时分类为高风险组，当所述RS(％)的设定值范围为25％或以上、且小于50％时分类为中度风险组，且当所述RS(％)的设定值范围小于25％时分类为低风险组：【公式1】RS＝HR1*normLogTransValue1+HR2*normLogTransValue2+...+HRn*normLogTransValuen；【公式2】RS(％)＝100×(生物学样本的RS‑总群组的RS最小值)/(总群组的RS最大值‑总群组的RS最小值)；在上述公式中，HRn表示第n个RNA转录本的风险比，且当所述HRn小于1时，将HRn转换成‑1/HRn来使用，normLogTransValuen指与第n个RNA转录本的表达相关的值，该值为相对于对应基因的总值以其中位数为中心进行大小变化的值，所述总群组指，一定数量的具有TNM分期中无淋巴结转移的T1N0期、T2N0期、T3N0期或T4N0期局部晚期胃癌的群组，且一定数量是指能够计算RS最大值和最小值的任一整数。