[发明专利]用于预测局部晚期胃癌预后的系统

说明书

技术领域

本发明涉及通过基因表达的对比分析法可预测局部晚期胃癌的预后的新型预测预后系统。

背景技术

在2000年造成700,349名死亡的原因中，胃腺癌(Gastric adeno-carcinoma)是第二大死因，是世界上最常诊断出来的第四大癌症。胃腺癌被视为具有几种流行病学和组织病理学特征的单一的异质性疾病。胃癌的治疗主要依据临床参数如TNM(肿瘤、淋巴结、转移)分期，TNM分期用于决定能否仅通过手术或通过手术和化疗法来进行治疗。与乳腺癌和大肠癌不同，胃癌会根据TNM分期系统的I期至IV期具有明显差异。亦即，I期的五年生存率为90％或以上，而IV期的五年生存率小于20％，可见差异巨大。由此可知，TNM分期系统具有优异的预后预测能力(参考文献、7th edition of the AJCC cancer staging Manual:stomach.Ann Surg Oncol2010；17:3077-3079)。基于TNM分期系统，胃癌通常被分为早期胃癌(Early Gastric Cancer)、局部晚期胃癌(Locally Advanced Gastric Cancer)、局部晚期浸润性胃癌(Locally Advanced Invasive Gastric Cancer)和转移性胃癌(Metastatic Gastric Cancer)等。

尽管手术是可实施的胃癌的主要治疗方法，然而晚期胃癌的复发率比较高。为了预防复发并提高胃癌患者的预后，导入了包括化疗和化放疗的综合治疗方法。然而，这种治疗方法虽能改善患者的常规临床结果，然而肿瘤的临床病理学的异质性和处于相同分期内患者的不同结果对预测辅助性化疗的任务上能力有限，从而不能足以最佳地接近个别患者。

肿瘤浸润和淋巴结转移的深度是胃癌中的两个主要预后因素。50％或以上的胃癌患者在诊断时伴有淋巴结转移，且出现了五年生存率小于30％的不良预后。因此，从胃癌患者中准确分类淋巴结转移是继胃癌根治术之后进行的治疗决定上起重要作用。然而，仅根据淋巴结的状态无法说明预后结果的异质性和化疗法药剂的任务。甚至于包括相同淋巴结分期的相同分期的患者都没有展示相同的预后结果。因此，原因在于内在临床异质性的肿瘤之间存在的鲜明的生物学差异是在研发治疗胃癌的新策略中的首要阶段。

由于胃癌是在流行病学和组织病理学上存在差异的异质性疾病，想要理解那些影响胃癌患者的预后结果的生物学特征是比较困难的。胃癌的预后结果中虽有包括扩散型和肠型胃癌等胃癌亚类在内的很多不同的预后因素，然而主要还是受分期的影响。然而，虽处于相同分期，但具有异质性的预后结果，且无法完整地说明大部分的异质性。在相同分期内，对预后结果的差异中存在原因的遗传性特征的鉴定在选择患者的治疗方案中起极为重要的作用。然而，已研发的大部分遗传性特征不太可能得以再现，且在选择治疗方案时可使用的信息也不足，从而无法应用在临床上。阻碍遗传性特征的预后导入的其他重要因素在于，这些预后中的任一种预后在定义胃癌患者的预后结果时都不能控制分期。因此，有必要向处于相同分期内的患者导入预后预测因素。

发明内容

技术问题

本发明的目的在于提供一种新型的预后预测系统，该系统可以基于基因表达的风险分数(Rsk Score,RS)，并查明对局部晚期胃癌，尤其在N0期(N0区域淋巴结转移)对胃癌患者的临床结果产生影响的重要生物学特征。

技术方案

为了实现所述目的，本发明提供用于预测被诊断为胃癌的患者的预后的方法、该方法包括如下步骤：在包括从受试者采集的癌细胞的生物学样本中测定GART、PTN、PCNA、GLI3、SMARCD3、SULT1A3、ILK、FUCA1、PKD1、TOP2A、ABL1、CKS2、FZD1、TIAL1、SGCD、PIGF、CCNB1、CSK、CRYAB、TPM1、RFC4、GUCY1B3、TYMS、FEN1、GNAI 1、CSRP1、UNG、AXL、MAP1B、VCL、ITGA5、LIG1、HPRT1、GRB2、HMMR、MCM4、SRF、DMPK、ACP5、CD38、PRIM1、CCNF、GLRB、IFNAR2、HSPA2、CLN3、BUB1、CALM1、CDC2、ATF4和RRM1的RNA转录本(transcript)的表达水平；及基于所述步骤中所确定的RNA转录本的表达水平，计算所述生物学样本的风险分数(RS)和RS百分比(RS(％))，然后根据所述RS(％)判断预后。