[发明专利]生物信息项目的分析报告自动生成方法及系统有效

专利信息
申请号: 201410742360.9 申请日: 2014-12-08
公开(公告)号: CN104484558B 公开(公告)日: 2018-04-24
发明(设计)人: 苏海桥;徐伟玲;石俊杰;邹利君;李卡麟;陈力春;梁绍光;李国庆;刘娜 申请(专利权)人: 深圳华大基因科技服务有限公司
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司44202 代理人: 梁顺宜,郝传鑫
地址: 518083 广东省深圳市*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 公开了一种生物信息项目的分析报告自动生成方法,包括步骤当子项目为只过滤子项目,即根据预设的参数配置运用统一的过滤标准对经测序仪测序完成后的样品下机数据进行过滤与分析,生成网页版或/和PDF版的分析结果报告;当子项目为标准化子项目,则该子项目对应的样品在经测序仪测序的同时,对该样品创建标准流程分析,且在创建每个标准流程分析过程中由用户根据当前子项目的样品情况输入对应的过滤参数;经测序仪测序完成后,先根据输入的过滤参数过滤掉部分样品数据,然后运用所创建的标准流程分析对剩下的每一样品数据进行过滤与分析生成网页版或/和PDF版的分析结果报告。
搜索关键词: 生物 信息 项目 分析 报告 自动 生成 方法 系统
【主权项】:
一种生物信息项目的分析报告自动生成方法,其特征在于,包括步骤:步骤一:创建项目并存于业务管理系统中,每个项目包括多个子项目;并选择所述创建项目中的子项目和任务信息;所述子项目的类型包括只过滤子项目和标准化子项目;其中,每个子项目的概要信息包括子项目代码、子项目名称、子项目类型、是否是只过滤、总的样品数、执行人、开始时间和结束时间、子项目状态以及子项目相关操作;步骤二:当所述子项目的类型为只过滤子项目,则根据选择的子项目类型和任务信息,依次从下机数据管理系统中获取对应的且经过测序仪测序后的样品数据;且每获取一个样品数据,即根据预设的参数配置运用统一的过滤标准进行过滤与分析,从而过滤不符合参数配置的样品数据;且待获取的所有样品数据过滤与分析完后,直接生成网页版或/和PDF版的分析结果报告报告,分析结果报告报告中包括子项目信息和对应的样品信息;步骤三:当所述子项目的类型为标准化子项目时,则该子项目对应的样品在经测序仪测序的同时,对该样品创建包括过滤分析、表达谱定量分析、差异比较分析、Cluster聚类分析、靶基因预测分析、KOGO分析和碱基编辑分析中的一种或多种的标准流程分析,且在创建每个标准流程分析过程中由用户根据当前子项目的样品情况输入对应的过滤参数;经测序仪测序完成后,根据所述 输入的过滤参数对每一样品数据进行过滤,从而去掉不符合过滤参数的样品数据;然后再运用所创建的标准流程分析对符合过滤参数的每一样品数据进行分析,直接生成网页版或/和PDF版的分析结果报告,分析结果报告包括子项目信息和对应的样品信息;步骤四:对所述分析结果报告进行质控,若质控通过,则直接输出该分析结果报告;若质控不通过,且所述分析结果报告和质控标准的差距在阈值范围内,则重新编辑所述样品数据或过滤/质控参数后再次进行步骤二或者步骤三的过滤与分析过程,直至分析结果报告通过质控;若质控不通过,且所述分析结果报告和质控标准的差距超过阈值,则编辑所述样品且废弃相关Lane,并在所述业务管理系统中重新下单。
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