[发明专利]基于蛋白‑蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法

摘要

本发明涉及一种基因技术领域的基于蛋白‑蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法，所述方法包括如下步骤从“数据集B”中找出和“集合A”发生直接相互作用的基因/蛋白，并命名为“节点集B”；统计“节点集B”中每个基因/蛋白和“集合A”发生直接相互作用的数目，命名为维度“i”；用具有不同最小维度“i”的“节点集B[i]”从“集合A”中调出那些相互作用的基因/蛋白，并被命名为“集合A[i]”；计算“集合A[i]”的聚集z值；具有最大聚集z值的“集合A[i]”为所得基因集。本发明的方法能够鉴定出和生物过程更加相关的基因集，有助于相关研究人员开展相关研究工作。

主权项

一种基于蛋白‑蛋白相互作用网络的基因集鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤一，从“数据集B”中找出和“集合A”发生直接相互作用的基因/蛋白，并命名为“节点集B”；“节点集B”中的基因/蛋白来自于“数据集B”，且和“集合A”没有共有基因/蛋白；步骤二，统计“节点集B”中每个基因/蛋白和“集合A”发生直接相互作用的数目，该数目被命名为“节点集B”中基因/蛋白的维度“i”，“节点集B”中的基因/蛋白具有不同的维度；步骤三，用具有不同最小维度“i”的“节点集B[i]”从“集合A”中调出那些相互作用的基因/蛋白，并被命名为“集合A[i]”，“集合A”中剩余的基因/蛋白被命名为“集合A[i]余”；步骤四，计算“集合A[i]”的聚集z值；步骤五，具有最大聚集z值的“集合A[i]”为所鉴定的基于蛋白‑蛋白相互作用网络的基因集；步骤一中，所述集合A为从相关全基因转录组研究数据获得的显著调变，且具有生物功能富集的基因集。