[发明专利]利用多个标记物确定核酸序列失衡在审
申请号: | 201410051659.X | 申请日: | 2008-07-23 |
公开(公告)号: | CN103902809A | 公开(公告)日: | 2014-07-02 |
发明(设计)人: | 卢煜明;赵慧君;陈君赐;徐仲锳;庄家俊 | 申请(专利权)人: | 香港中文大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06F19/18;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 中国香*** | 国省代码: | 中国香港;81 |
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摘要: | 本发明提供了利用多个标记物确定核酸序列失衡的方法、系统和装置。选取了用于确定,例如,两个序列(或两组序列)的比率的失衡的一个或多个截止值。可以至少部分地基于含有母体核酸序列背景的诸如母体血浆的样品中胎儿DNA的百分比来确定所述截止值。还可以基于每一反应的序列的平均浓度来确定该截止值。在一方面,从估计含有特定核酸序列的信息孔的比例来确定该截止值,其中该比例基于上文所述的百分比和/或平均浓度来确定。可以利用诸如序贯概率比检验(SPRT)的许多不同类型的方法来确定该截止值。 | ||
搜索关键词: | 利用 标记 确定 核酸 序列 失衡 | ||
【主权项】:
确定怀有胎儿的女性个体的生物样品中是否存在核酸序列失衡的方法,其中所述生物样品包括来自所述女性个体和来自所述胎儿的无细胞核酸分子,所述方法包括:接收来自多个反应的定量数据,所述反应包括来自所述生物样品的无细胞核酸分子,其中所述数据包括:对于多个临床相关的核酸序列:(1)表示所述多个反应中临床相关的核酸序列的第一总量的第一定量数据;和对于多个背景核酸序列:(2)表示多个反应中背景核酸序列的第二总量的第二定量数据,其中所述背景核酸序列不同于所述临床相关的核酸序列中的任何一种;从所述第一定量数据确定所述第一总量;从所述第二定量数据确定所述第二总量;从所述第一总量和所述第二总量确定参数,其中所述参数提供所述第一总量和所述第二总量之间的相对量;将所述参数与一个或多个截止值比较;以及基于比较,确定所述胎儿基因组中临床相关的核酸序列是否存在核酸序列失衡的分类。
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
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