[发明专利]一种菠萝成熟衰老相关基因的分子标记方法无效
| 申请号： | 201310607475.2 | 申请日： | 2013-11-27 |
| 公开（公告）号： | CN103642908A | 公开（公告）日： | 2014-03-19 |
| 发明（设计）人： | 张鲁斌;常金梅;贾志伟;谷会;弓德强;洪克前 | 申请（专利权）人： | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 524091 *** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供一种菠萝成熟衰老相关基因的分子标记方法：提取采后菠萝衰老过程各阶段的RNA；对菠萝成熟衰老过程中的转录组进行了测序，组装得到了81129个unique基因；在此基础上使用SSR软件MicroSAtellite(MISA)进行了SSR扫描，找到了35099个SSR分子标记，供菠萝多态性分析；对所有SSR重复单元在Unigene上前后序列的长度进行筛选。只保留前后序列均不小于150bp的SSR，用其设计引物；不同物种间，进行PCR扩增并通过PAGE技术进行多态性检测。通过本发明，获得了菠萝衰老相关的基因表达谱，然后对获得的序列进行SSR标记扫描，确认其多态性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 菠萝 成熟 衰老 相关 基因 分子 标记 方法 | ||
【主权项】：
一种菠萝成熟衰老相关基因的分子标记方法，其特征在于，它包括如下步骤：(1)提取采后菠萝衰老过程各阶段的RNA；(2)通过Illumina Solexa Hiseq2000对菠萝成熟衰老过程中的转录组进行了测序，组装得到了81129个unique基因；(3)在此基础上使用SSR软件MicroSAtellite(MISA)进行了SSR扫描，找到了35099个SSR分子标记，供菠萝多态性分析；(4)对所有SSR重复单元在Unigene上前后序列的长度进行筛选。只保留前后序列均不小于150bp的SSR，用其设计引物；(5)不同物种间，进行PCR扩增并通过PAGE技术进行多态性检测。
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