[发明专利]基于颜色的逆转录等温扩增技术检测肠道病毒基因组5’-UTR

摘要

本发明属于生物技术应用领域，涉及各级疾病预防控制机构，手足口病检测网络实验室，哨点医院等用于对手足口病疑似病患咽拭子、肛拭子、脑脊液、疱疹液、粪便等标本的肠道病毒感染的检测和监测。具体是应用基于颜色的逆转录等温扩增技术(RT-GEAR)，通过计算机软件分析肠道病毒基因组5’-UTR的保守序列，分别设计出四条引物完全与识别基因靶序列中五个结合区匹配，并于反应前加入HNB(羟基萘酚蓝)染料，只需一步就可完成在63℃等温环境中扩增1小时，最后用肉眼观察染料颜色变化和管底的白色沉淀判定检测结果，与传统的病毒分离、血清学检测、RT-PCR方法等比较，它具有更安全、特异、灵敏、便捷的优势。

主权项

一种用于肠道病毒感染的检测，基于HNB(羟基萘酚蓝)颜色的逆转录等温扩增技术(RT‑GEAR)，其中包括：用于肠道病毒基因组5’‑UTR(Untranslated Region，非翻译区)检测的4条寡核苷酸引物和HNB(羟基萘酚蓝)染料。所述引物序列为： panEV‑FT：5’‑GTTAGGATTAGCCGCATTCAGGGGGTGTGAAGAGTCTATTGAGCT‑3′ panEV‑BT：5’‑CCCTGAATGCGGCTAATCCTAACGAAACACGGACACCCAAA‑3′ panEV‑IF：5’‑GCCGGAGGACTACTAACT‑3′ panEV‑IR：5’‑GCAGCGGAACCGACTAC‑3′。