[发明专利]多维矩阵用于像药型化合物分子设计的应用及像药型化合物分子设计方法有效
申请号: | 201210100888.7 | 申请日: | 2012-04-09 |
公开(公告)号: | CN102646171A | 公开(公告)日: | 2012-08-22 |
发明(设计)人: | 闫京波;霍秀敏 | 申请(专利权)人: | 闫京波;霍秀敏 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 11003 | 代理人: | 尹振启 |
地址: | 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及多维矩阵用于像药型化合物设计的应用及像药型化合物设计方法,该方法首次将数学的矩阵优化理念应用于像药型化合物及其相关的分子设计领域,并采用多维矩阵排列分析目标化合物的核心结构与可变因素及其变量,生成“像药”型化合物结构类型。该方法可以显著提高像药型化合物设计的全面性、系统性、针对性、有效性和设计效率,并显著提高合成效率,丰富像药型化合物的收藏。 | ||
搜索关键词: | 多维 矩阵 用于 像药型 化合物 分子 设计 应用 方法 | ||
【主权项】:
一种像药型化合物结构的设计方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:(1)将目标化合物按照基本结构单元进行结构分区,分别以大写字母A,B,C,D...Y或Z代表相应的结构区域,所述基本结构单元包括饱和或不饱和单环、双环、多环环状化合物结构,取代基或官能团;(2)参照经验型数据,确定影响目标化合物靶标生物活性/细胞活性的结构部分,将其作为核心结构区域;(3)参照经验型数据,选择影响目标化合物其它性质的可变因素及其变量,所述的可变因素分别以小写字母a,b,c,d...y或z加以表示,所述a的变量选自a1、a2、a3...an,所述b的变量选自b1、b2、b3...bn,所述c的变量选自c1、c2、c3...cn,所述的变量d选自d1,d2,d3...dn,所述y的变量选自y1、y2、y3...yn,所述z的变量选自z1、z2、z3...zn,其中,n为自然数;(4)采用多维矩阵排列分析步骤(2)所述的核心结构和步骤(3)生成的可变因素,生成“像药”型化合物结构类型,优选参照经验型数据,采用多维矩阵比对分析步骤(2)所述的核心结构和步骤(3)生成的可变因素,根据结构比对分析结果,生成“像药”型化合物结构类型。
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G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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