[发明专利]多维矩阵用于像药型化合物分子设计的应用及像药型化合物分子设计方法

权利要求书

1.一种像药型化合物结构的设计方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

(1)将目标化合物按照基本结构单元进行结构分区，分别以大写字母A，B，C，D...Y或Z代表相应的结构区域，所述基本结构单元包括饱和或不饱和单环、双环、多环环状化合物结构，取代基或官能团；

(2)参照经验型数据，确定影响目标化合物靶标生物活性/细胞活性的结构部分，将其作为核心结构区域；

(3)参照经验型数据，选择影响目标化合物其它性质的可变因素及其变量，所述的可变因素分别以小写字母a，b，c，d...y或z加以表示，所述a的变量选自a1、a2、a3...an，所述b的变量选自b1、b2、b3...bn，所述c的变量选自c1、c2、c3...cn，所述的变量d选自d1，d2，d3...dn，所述y的变量选自y1、y2、y3...yn，所述z的变量选自z1、z2、z3...zn，其中，n为自然数；

(4)采用多维矩阵排列分析步骤(2)所述的核心结构和步骤(3)生成的可变因素，生成“像药”型化合物结构类型，优选参照经验型数据，采用多维矩阵比对分析步骤(2)所述的核心结构和步骤(3)生成的可变因素，根据结构比对分析结果，生成“像药”型化合物结构类型。

2.根据权利要求1的方法，其特征在于，所述经验型数据选自靶标生物活性、靶标生物选择性、毒副作用、细胞活性、ADME性质、像药性、可合成性的任一种或其组合。

3.根据权利要求1或2的方法，其特征在于，所述可变因素为连接区域或碎片区域。

4.根据权利要求3的方法，其特征在于，通过如下任一或全部方式确定所述碎片的结构类型：

a)生成最接近于基本化合物结构单元类型的碎片；

b)将步骤a)生成的碎片结构类型与经验型数据进行化合物结构对比，优选采用多维矩阵将步骤a)生成的碎片结构类型与经验型数据进行化合物结构对比；

c)根据步骤b)所得的结构对比结果，生成碎片式药物构架化合物结构类型。

5.根据权利要求3的方法，其特征在于，通过如下任一或全部方式确定连接的结构类型：

a)生成连接(连结)结构类型；

b)将步骤a)生成的连接结构类型与经验型数据进行化合物结构对比，优选采用多维矩阵将步骤a)生成的连接结构类型与经验型数据进行化合物结构对比；

c)根据步骤b)所得的结构对比结果，生成连接式药物构架化合物结构类型。

6.根据权利要求1-5任一项的方法，其特征在于，根据如下任一或全部方式确定核心结构区域：

a)采用多维矩阵方式进行化合物的结构构成和合成可行性的优化分析；

b)根据优化分析的结果，产生出可以用于构造和/或合成核心结构的药物构架化合物的结构类型；

c)采用多维矩阵将步骤b)生成的可以用于构造和/或合成核心结构的药物构架化合物的结构类型与经验型数据进行化合物结构对比；

d)根据步骤c)所得的结构对比结果，生成可以构成和/或合成与前述核心结构不完全相同的核心结构的药物构架化合物结构类型；

e)对于新生成的药物构架化合物结构类型进行合成可行性分析，确定新型核心结构类型。

7.根据权利要求1-6任一项的方法，其特征在于，采用多维矩阵重新组合“像药”型化合物的组成部分，得出结构对比和结构优化的新型“像药”型化合物结构类型，优选所述的组成部分选自碎片或连接的任一种或组合，更优选参照经验型数据重新组合“像药”型化合物的组成部分。

8.根据权利要求1-7任一项的方法，其特征在于，参照靶标信息和/或同类化合物的已知结构来确定目标化合物的核心结构。

9.根据权利要求1-8任一项的方法，所述的目标化合物选自上市药物、处于临床阶段的候选药物、处于临床前研究的候选药物、先导化合物、具备生物活性的天然产物、中药单体化合物、中药有效成分、被验证的具备生物活性的像药性化合物、计算机辅助药物分子设计(CADD设计化合物)、高通量筛选化合物、已知靶标蛋白质空间立体结构及其靶点区域的空间立体结构的任一种或其组合。

10.多维矩阵在像药型化合物分子设计中的应用，其特征在于，通过目标化合物的结构区域与经验型数据确定多维矩阵。