[发明专利]甘蔗细胞壁结合转化酶基因及其编码蛋白序列无效
申请号: | 201110364661.9 | 申请日: | 2011-11-17 |
公开(公告)号: | CN102533817A | 公开(公告)日: | 2012-07-04 |
发明(设计)人: | 王爱勤;牛俊奇;刘铭;杨丽涛;李杨瑞 | 申请(专利权)人: | 广西大学 |
主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N9/24 |
代理公司: | 广西南宁汇博专利代理有限公司 45114 | 代理人: | 邹超贤 |
地址: | 530004 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | 本发明公开了一种甘蔗细胞壁结合转化酶基因及其编码蛋白序列,在对所有植物细胞壁结合转化酶基因全长序列进行进化分析的基础上,以同一家族的细胞壁结核转化酶基因序列的保守区设计引物,从甘蔗幼嫩叶片提取总RNA,并经反转录,用常规PCR法扩增,结合RACE技术克隆到甘蔗细胞壁结合转化酶(SoCWI)基因的全长cDNA序列,不仅为研究甘蔗细胞壁结合转化酶的转录和表达机制,进一步探讨蔗糖的积累机理奠定基础,而且通过氨基酸序列可以获得具有生物活性的纯化蛋白,解决了糖基水解酶(glycosyl hydrolase familie)四个基因家族:GH32,GH43,GH62,GH68中甘蔗CWI基因的GH32家族目前只克隆出了一个CWI cDNA序列片段(AY302084)没有解决的技术难点,为研究细胞壁结核转化酶的生物学功能提供基础。 | ||
搜索关键词: | 甘蔗 细胞壁 结合 转化 基因 及其 编码 蛋白 序列 | ||
【主权项】:
1.甘蔗细胞壁结合转化酶基因及其编码蛋白序列,其特征在于:a.甘蔗细胞壁结合转化酶(SoCWI)基因,它具有序列表中SEQID NO.1的DNA序列,且它的编码区从第62位核苷酸到1792位核苷酸;甘蔗SoCWI基因的全长cDNA序列:gaaaaccatccatcgtccaaaaccgtccccctcttcctgctgccgcatcctcagaaacgca
gggactcggcagcgggtcctcgcgccatgggcggtgctgctgctcgcgctgcaggtcgccggtgcctcccatgtcatccaccggagcctggaggccgaggcggcaccgccgtcggtgcctgcctccattgtcagccccctgctcaggacggggtaccatttccagccgccaatgaactggatcaacgaccccaacgctccgatgtactacaagggatggtatcacttgttctaccagtacaaccccaagggcgcagtatggggcaacatcgtctgggcacactccgtgtcacgcgacctcatcaactggatcgcgctggatcccgccatctacccgagcatcccctccgatcagtacggctgctggtcgggctcggcgacgatgctgaaagacggcacgccggcgatcctgtacacggggatcaaccgccccgacatcaactaccaggtgccggtgatcgcgttcccgaagaacgcgtcggacccgctgctccgggagtgggagaagcccgcggcgtacaacccggtggcgacgccggtgggcggcatcaacgcgacgcagttccgcgacccgacgacggcgtggtacgcggacgggcactggcggatgctcgtgggcagcgtgcgggacacccggggcatggcgctcgtgtaccggagccgggacttcaagacgtggaggaaggccaagcacccgctgcactcggcgctgacggggatgtgggagtgcccggacttcttcccggtgtccgggccggcgctcgaggacgggctcgacacctccgacgccggcgccaagtacgtgctcaagagcagcctggacctcacacggtatgactactacaccatcgggtcgtacgacaagaggaaggaccggtactacccggataacccgaacggtgactaccaccggctgcggtacgactacggcaacttctacgcgtccaagacgttctacgacccggcgaagcggcggcgggtgctgctcgggtgggctaacgagtcggacagcgtgcccgacgacaaggccaagggctgggccggcatccatgcgatcccaaggaagatctggctcgaccccagcgggaagcagctgctgcagtggcccatcgaggaggttgagaagctcagaggaaagcccgtcagtgtgggcagcaagctagtcaagcccggcgagcattttgaggtcacaggcgtcgcgacctaccaggctgatgtggaggtgaccttcgagatctccagcttggagaaggcggaggcgttcgacccggcgtacgacaacgacgcgcagaagctgtgcggcgtcaagggtgcggacgtcaagggtcgggtggggcccttcggcctgtgggtgctggcctctgccgacctgcaggagaagacggccgtcttcttcagagtcttcaaggacggatacggcaagcccaaggtgctcatgtgcaccgaccccacaaagtcctctcttagtccagatctgtacaagccaaccttcgcgggcttcgtcgacactgacatttcaagcgggaagattgctcttagaagcttgatcgatcggtccgtggtggagagcttcggcgcgggaggcaagacgtgcatcctgtcacgggtctacccgtccatcgccattggaaaggacgcgcacctctacgttttcaacaacggtgaggtggacgtcaaagtgtcaagcctgaccgcctgggagatgaagaaaccgctcatgaacggcgcc
aagcgtggatgactttattcgtttctcttcaacgattgctgccagaaatactattgattattaattgttgaggtccttcagttttcgcccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaa;b.SoCWI编码的蛋白,是具有序列表中SEQID NO.2氨基酸残基序列的蛋白质,或者是将SEQID NO.2的氨基酸残基序列经过一个以上氨基酸残基的取代和/或缺失或添加且具有与SEQID NO.2的氨基酸残基序列相同活性的衍生蛋白质;甘蔗SoCWI基因所编码蛋白的氨基酸序列:MGTRQRVLAPWAVLLLALQVAGASHVIHRSLEAEAAPPSVPASIVSPLLRTGYHFQPPMNWINDPNAPMYYKGWYHLFYQYNPKGAVWGNIVWAHSVSRDLINWIALDPAIYPSIPSDQYGCWSGSATMLKDGTPAILYTGINRPDINYQVPVIAFPKNASDPLLREWEKPAAYNPVATPVGGINATQFRDPTTAWYADGHWRMLVGSVRDTRGMALVYRSRDFKTWRKAKHPLHSALTGMWECPDFFPVSGPALEDGLDTSDAGAKYVLKSSLDLTRYDYYTIGSYDKRKDRYYPDNPNGDYHRLRYDYGNFYASKTFYDPAKRRRVLLGWANESDSVPDDKAKGWAGIHAIPRKIWLDPSGKQLLQWPIEEVEKLRGKPVSVGSKLVKPGEHFEVTGVATYQADVEVTFEISSLEKAEAFDPAYDNDAQKLCGVKGADVKGRVGPFGLWVLASADLQEKTAVFFRVFKDGYGKPKVLMCTDPTKSSLSPDLYKPTFAGFVDTDISSGKIALRSLIDRSVVESFGAGGKTCILSRVYPSIAIGKDAHLYVFNNGFVDVKVSSLTAWEMKKPLMNGA。
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