[发明专利]一种长非编码核糖核酸靶基因预测方法无效
申请号: | 201010258125.6 | 申请日: | 2010-08-19 |
公开(公告)号: | CN102375940A | 公开(公告)日: | 2012-03-14 |
发明(设计)人: | 陈喆;吴剑丙;刘培 | 申请(专利权)人: | 浙江中医药大学附属第一医院 |
主分类号: | G06F19/14 | 分类号: | G06F19/14;C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 310006*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明根据长非编码RNA的靶基因作用规律,找到了一种可行的长非编码RNA的靶基因的生物信息学方法,可直接针对长非编码RNA的靶基因内进行锁定,以便于进一步的实验验证。本发明主要包括如下流程:步骤1:获取感兴趣的基因集合;步骤2:建立长非编码RNA数据库;步骤3:长非编码RNA的顺式靶基因预测;步骤4:长非编码RNA的反式靶基因预测。最终,靶向感兴趣基因的长非编码RNA,可以直接进行实验验证。 | ||
搜索关键词: | 一种 编码 核糖核酸 基因 预测 方法 | ||
【主权项】:
本发明所述的一种长非编码核糖核酸靶基因预测方法,其特征在于:同时考虑了顺式靶基因反式靶基因问题预测结果更全面,包括如下几个步骤:步骤1:获取感兴趣的基因集合;步骤2:建立长非编码RNA数据库;步骤3:长非编码RNA的顺式靶基因预测;步骤4:长非编码RNA的反式靶基因预测。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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