[发明专利]一种针对目标生物的目标基因建立系统进化树的方法无效
申请号: | 200910158233.3 | 申请日: | 2009-07-23 |
公开(公告)号: | CN101962671A | 公开(公告)日: | 2011-02-02 |
发明(设计)人: | 王颖 | 申请(专利权)人: | 王颖 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F17/30 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 322000 浙江省义乌*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明涉及一种针对目标生物的目标基因建立系统进化树的方法,所述方法包括如下步骤:1)数据的获取;2)序列的比对和分析;和3)系统进化树的构建;其中,在所述第1)步骤中,下载所述目标基因的蛋白的结构域,通过基因组或蛋白组已经测序完成的生物蛋白数据库搜索获取含有所述结构域的序列,并使用基因组或蛋白组已经测序完成的生物的目标基因搜索近缘植物的蛋白序列。由于本发明方法包括上述步骤,尤其是从物种亲缘关系和基因组或蛋白组完成测序的数据库两方面予以结合,因此可以建立更加准确的系统进化树。 | ||
搜索关键词: | 一种 针对 目标 生物 基因 建立 系统 进化 方法 | ||
【主权项】:
一种针对目标生物的目标基因建立系统进化树的方法,所述方法包括如下步骤:1)数据的获取;2)序列的比对和分析;和3)系统进化树的构建;其中,在第1)步骤中,下载所述目标基因的蛋白的结构域,通过基因组或蛋白组已经测序完成的生物蛋白数据库搜索获取含有所述结构域的序列,并使用基因组或蛋白组已经测序完成的生物的相应目标基因搜索近缘植物的蛋白序列。
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