[发明专利]头颈鳞癌分子分类诊断用小型化寡核苷酸芯片

摘要

本发明涉及一种头颈鳞癌分子分类诊断用小型化寡核苷酸芯片，以及一种头颈鳞癌分子分类诊断方法。一种头颈鳞癌分子分类诊断用小型化寡核苷酸芯片，由与头颈鳞癌显著相关的一些基因序列构成相应的寡核苷酸探针，制备成小型化诊断用芯片，所述探针为下列寡核苷酸序列，共代表39条基因。本发明采用头颈鳞癌分子分类专用的小型诊断芯片替代传统的高通量大芯片，显著降低了成本，简化了操作过程。该专用芯片的获取系使用多种统计分析标准，多种统计学方法相结合：A和B基因群的交集和COM框架(C基因群)。通过综合使用这些方法，保留不同统计方法敏感性高的优点(参数/非参数/混合参数，差异平均值/平均值的差异)，同时克服了不同统计学方法所带来的假阳性率困扰。

主权项

1，一种头颈鳞癌分子分类诊断用小型化寡核苷酸芯片，由与头颈鳞癌显著相关的一些基因序列构成相应的寡核苷酸探针，制备成小型化诊断用芯片，其特征在于，所述探针为下列寡核苷酸序列，共代表39条基因，包括：EMP1、CEACAM5、NA、ZNF185、ACPP、COL1A2、HPGD、TGM3、ITGA6、NMU、OPN、SCEL、COL1A1、COL4A2、KRT13、PPL、PP11、CYP3A5、PLAU、IL1RN、PITX1、MAI、BLNK、FN1、COL5A2、MMP1、MFAP2、SERPINH2、COLAA1、KRT4、LAGY、C5ORF13、FAPA、SPINK5、KIAA0790、DUSP5、PTHLH、GPX3、CEACAM1。