[发明专利]植物组学;应用于草药组合物的以基因组为依据的方法

权利要求书

1.用于预测草药组合物生物学活性的方法，包括：

a)将生物系统暴露于成批的草药组合物并且测量两种或多种分子标记的差异反应，其中差异反应测量的集合组成了草药生物反应阵列(HBR阵列)的数据集；

b)将该批草药组合物HBR阵列与至少一个先前获得的具有至少一种已知生物学活性的、已知的草药组合物的HBR阵列进行比较；和，

c)基于在步骤b)中所作的HBR阵列的比较来预测该批草药组合物的生物学活性。

2.权利要求1的方法，进一步地包括对于草药组合物的另外的一个或更多个批次重复步骤a)直至c)，并且选择具有期望的生物学活性的成批的草药组合物。

3.权利要求1的方法，其中使用其它的先前获得的HBR阵列来与步骤b)的HBR阵列进行比较。

4.权利要求1或3的方法，其中标记选自分子标记、细胞遗传学标记、生物化学标记和大分子标记。

5.权利要求1或3的方法，其中先前贮存的HBR阵列是与该批草药组合物的HBR阵列相同的或基本相似的草药组合物的标准化的HBR阵列。

6.权利要求5的方法，进一步地包括调整或修饰批草药组合物以产生与一个或多个标准化的HBR阵列基本相似的HBR阵列。

7.权利要求1或3的方法，进一步地包括使用HBR阵列的比较结果来鉴定在批草药组合物中的保留了已知草药组合物的期望的生物学活性特定分子。

8.权利要求1或3的方法，进一步地包括使用HBR阵列的比较结果来确定哪种已知草药组合物的草药成分可以从已知的草药组合物中排除仍能维持或改善已知草药组合物的期望的生物学活性。

9.权利要求1或3的方法，其中HBR阵列比较的结果鉴定了一种或多种批草药组合物先前已知的生物学活性。

10.权利要求1或3的方法，进一步地包括使用批草药组合物预测的生物学活性来帮助设计包括草药组合物和合成的化学药物的治疗方法。

11.建立草药组合物的标准化的草药生物反应阵列(HBR阵列)的方法，其中该方法包括：

a)选择至少具有一种已知生物反应的草药组合物；

b)将生物系统暴露于草药组合物并且选择两种或多种标记的数据；

c)贮存步骤(b)的标记数据作为一个HBR阵列；

d)对使用两种或多种与在步骤b)中使用的标记相同或不同的标记的草药组合物的批重复步骤b)和c)；

e)组合在步骤c)和d)中获得的HBR阵列；和，

f)分析步骤e)组合的HBR阵列以产生草药组合物的标准化的HBR阵列，其中标准化的HBR阵列具有两种或多种至少与草药组合物的一种已知的生物反应相关的标记的数据。

12.权利要求11的方法，进一步地包括将生物系统暴露于一种或多种草药组合物，选择关于一种或多种生物反应的数据，和将收集的生物反应数据加到那个草药组合物的标准化的HBR阵列中。

13.一种评价草药组合物的方法，包括：

a).将生物系统暴露于草药组合物并且收集两种或多种标记的数据；和

b).把收集到的标记数据和与批草药组合物相同或基本相同的草药组合物的标准化HBR阵列进行比较。

14.权利要求13的方法，进一步地包括预测该批草药组合物的生物反应。

15.权利要求11或13的方法，其中标记选自分子的、细胞遗传学的、生物化学的和大分子的标记。

16.权利要求11或13的方法，其中标准化的HBR阵列进一步地包括关于植物相关数据的信息。

17.建立具有已知生物反应的草药组合物的标准化的草药生物反应阵列(HBR阵列)的方法，其中该方法包括：

a).将生物系统暴露于批草药组合物并且测量结果基因表达的质和量的改变以产生那个批的作为一个数据的HBR阵列；

b).使用不同草药组合物的制剂重复步骤a)以产生数据作为附加的HBR阵列；

c).通过分析在步骤a)和b)中获得的HBR阵列来选择一套不同的遗传标记以建立草药组合物的标准化的HBR阵列。