[发明专利]一种用于空间定向组装生物分子保持其生物活性的刚性超大DNA四面体的构建及应用在审

专利信息
申请号: 202310675612.X 申请日: 2023-06-08
公开(公告)号: CN116656672A 公开(公告)日: 2023-08-29
发明(设计)人: 吴再生;王伟军;何腾航;林梦玲;陈雅鑫 申请(专利权)人: 福州大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;B82Y30/00;B82Y40/00
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司 35100 代理人: 林文弘;蔡学俊
地址: 350108 福建省福州市*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 空间 定向 组装 生物 分子 保持 活性 刚性 超大 dna 四面体 构建 应用
【权利要求书】:

1.一种刚性超大DNA四面体材料,其特征在于:由如下12条单链DNA探针组装而成:核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的Ta-1,核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的Ta-2,核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的Ta-3,核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的Tb-1,核苷酸序列如SEQ IDNO.5所示的Tb-2,核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示的Tb-3,核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示的Tc-1,核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示的Tc-2,核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示的Tc-3,核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示的Td-1:核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示的Td-2,核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示的Td-3。

2.一种构建权利要求1所述刚性超大DNA四面体材料的制备方法,其特征在于:包括以下步骤:

(1)三角面Δabc的组装:将等摩尔量的单链DNA探针Ta-1、Ta-2和Ta-3加入至1×T4DNA 连接酶缓冲液中,在缓降型金属浴中进行退火缓降处理,形成三角面Δabc;

(2)三角面Δabd的组装:将等摩尔量的单链DNA探针Tb-1、Tb-2和Tb-3加入至1×T4DNA 连接酶缓冲液中,在缓降型金属浴中进行退火缓降处理,形成三角面Δabd;

(3)三角面Δacd的组装:将等摩尔量的单链DNA探针Tc-1、Tc-2和Tc-3加入至1×T4DNA 连接酶缓冲液中,在缓降型金属浴中进行退火缓降处理,形成三角面Δacd;

(4)三角面Δbcd的组装:将等摩尔量的单链DNA探针Td-2和Td-3加入至1×T4 DNA连接酶缓冲液中,在缓降型金属浴中进行退火缓降处理,然后加入与DNA探针Td-2等摩尔量的DNA探针Td-1并在室温下孵育1 h,形成三角面Δbcd;

(5)RDT的组装:将三角面Δabc、Δabd、Δacd和Δbcd等摩尔量混合并在室温下孵育1h,形成刚性超大DNA四面体材料。

3.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于:所述退火缓降处理为:先90℃退火5min,再在1 h内冷却至室温。

4.一种改造权利要求1所述刚性超大DNA四面体材料的方法,其特征在于:在单链DNA探针上增加粘性末端,使得组装形成的刚性超大DNA四面体材料具有粘性末端,从而赋予刚性超大DNA四面体材料空间定向组装生物分子并保持生物分子生物活性的能力。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述在单链DNA探针上增加粘性末端具体是在Ta-1、Ta-2、Tc-2和Td-2上增加粘性末端;Ta-1增加粘性末端后核苷酸序列如SEQ IDNO.13所示,Ta-2增加粘性末端后核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示,Tc-1增加粘性末端后核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示,Td-2增加粘性末端后核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示。

6.根据权利4所述的方法,其特征在于:所述生物分子包括核酸序列、辣根过氧化物酶、核酸适配体。

7.一种由权利要求4所述的方法改造而来的刚性超大DNA四面体材料。

8.根据权利要求7所述的刚性超大DNA四面体材料,其特征在于:所述刚性超大DNA四面体材料可通过胆固醇基团修饰的锚定链精准定向组装在Si-DLBM表面;所述胆固醇基团修饰的锚定链为:

Chol-cTa-1E:5’-Chol-TTTTTTTTTTCGATCATCAGGCCAATTACTAGA-3’,

cTa-2E-Chol:5’-GACATATGCTGCCTATCTTCGATTTTTTTTTTT-Chol-3’,

cTc-2E-Chol:5’-GCATGCTAATTGGATCGGATTCTTTTTTTTTTT-Chol-3’,

Chol-cTd-2E:5’-Chol-TTTTTTTTTTCTCTAGGCAGCTGGTGGTCTTGA-3’。

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