[发明专利]一种南酸枣遗传多样性评价的SSR分子标记组合及其应用

说明书

本发明公开了一种南酸枣遗传多样性评价的SSR分子标记组合及其应用，涉及分子遗传学技术领域。该SSR分子标记组合包括分子标记NSZ‑43385、NSZ‑9141、NSZ‑37910、NSZ‑240、NSZ‑22900、NSZ‑39803、NSZ‑42088、NSZ‑165、NSZ‑26522、NSZ‑39039、NSZ‑41051、NSZ‑1007、NSZ‑36575、NSZ‑37045、NSZ‑34772和NSZ‑45650。该SSR分子标记组合可用于南酸枣遗传多样性评价，进行南酸枣不同群体的遗传多样性研究，对制定南酸枣种质资源有效保护和可持续利用策略等方面具有重要指导意义。

技术领域

本发明涉及分子遗传学技术领域，特别是涉及一种南酸枣遗传多样性评价的SSR分子标记组合及其应用。

背景技术

南酸枣(Choerospondias axillaris(Roxb.)Burtt et Hill.)为漆树科(Anacardiaceae)南酸枣属单一种，果实营养价值高、成分丰富，是一个经济、生态、社会等效益俱佳的林果兼用树种。南酸枣叶可作肥、木材用途广泛，树皮和叶可提栲胶。果可生食或酿酒。果核可做活性炭原料。茎皮纤维可作绳索。树皮和果入药，有消炎解毒、止血止痛之效，外用治大面积水火烧烫伤等药用价值。由于南酸枣的适应性较强，李冬等人发现其主要能分布在温度、降水敏感性较大的区域。叶学敏等人发现由于地域气候不同，导致不同生境中的南酸枣表型变异很大，同时果实的营养成分变异也比较明显，物候期和病害抗性之间也有较大差异。此外在田华林等人对南酸枣天然林资源的调查研究及南酸枣幼林苗期性状变异研究中发现南酸枣苗期性状在种内变异也较大，在种源间均存在极显著差异，且均有较高的广义遗传力，有助于优树挑选。这些都可表明南酸枣在我国亚热带、热带地区的长期进化过程中积累了丰富的种内遗传变异。遗传变异是进行物种遗传改良的重要的物质基础，目前南酸枣遗传多样性研究报道较少，分子遗传学的相关研究包括杨春霞等人基于高通量测序对南酸枣转录组进行了分析；叶金山等人则建立并优化了南酸枣ISSR-PCR反应体系。

微卫星标记，也叫做短串联重复(Short tandem repeats，STRs)，简单重复序列(Simple sequence repeat，SSR)，是由1～6个碱基的串联重复单元组成的，广泛存在于真核和原核生物的基因组中。Hamada等人研究发现在真核生物中(酵母到脊椎动物)都存在很多微卫星，后来Delseny、Tautz和Renz等研究发现并证实了在植物和其他很多真核生物中都存在丰富的微卫星。由于植物中富含AT重复而动物中富含AC重复，重复的部分不同，从而揭示出植物和动物基因组之间的区别。SSRs分布在基因组的编码区和非编码区，分布在整个细胞核基因组中。在基因组中大约有104～105个SSR，其多态性高，多态性是由于在微卫星区域内的不同重复，因此通过PCR可以很容易的被检测到，可见SSR分子标记是一个非常重要且实用便捷的工具。经过长时间的进化，生物体内部的核苷酸之间会发生不相等的交换，之后渐渐积累出不同重复频次的碱基。在不同的生物体中，即使是在同一微卫星位点，因重复单位数目的不同，而使得微卫星发生突变而呈现丰富的多态性，且此突变并不对生物体产生危害所以生物体染色体内丰富的微卫星变异得以长久存在。SSR标记具有突变快、较高的多态性和稳定性、丰富的信息含量、分布广泛以及具有共显性等优点，可以作为优良的遗传标记类型(Kuroda et al.，2006)。目前，该技术广泛用于群体遗传多样性研究等领域。开发一种南酸枣遗传多样性评价的SSR分子标记，应用于南酸枣不同群体的遗传多样性研究，将对于分析该物种不同居群的遗传结构和遗传多样性，制定南酸枣种质资源有效保护和可持续利用策略等方面具有重要指导意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种南酸枣遗传多样性评价的SSR分子标记组合及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，该SSR分子标记组合可用于进行南酸枣遗传多样性评价，用于南酸枣不同群体的遗传多样性研究，对于分析该物种不同群体的遗传结构和遗传多样性，制定南酸枣种质资源有效保护和可持续利用策略等方面具有重要指导意义。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：